Zdzisława Krzyszkowiaka w Bydgoszczy thumb|Finał biegu mężczyzn na 5000 m
Wybór organizatora Początkowo gospodarzem zawodów Rada IAAF wybrała, w kwietniu 2014 roku w Eugene, Kazań – był on jedynym kandydatem do organizacji mistrzostw. Jesienią 2015 roku, w związku ze skandalem dopingowym w Rosji, IAAF zawiesił w prawach członka Wszechrosyjską Federację Lekkiej Atletyki. Na mocy tej decyzji Rosja straciła m.in. prawo do organizacji mistrzostw świata juniorów. Na początku grudnia 2015 IAAF rozpoczął procedurę wyboru nowego gospodarza zawodów. Wstępną aplikację do władz światowej lekkoatletyki zgłosiły wówczas trzy krajowe związki lekkoatletyczne: Australia (wysunęła kandydaturę Perth), Polska (Bydgoszcz) oraz Indie (nie wskazały konkretnego miasta, później ustalono, że będzie to Nowe Delhi). 22 grudnia 2015 ogłoszono, że Perth nie będzie ubiegać się o organizację zawodów – decyzję argumentowano zbyt krótkim czasem na przygotowanie mistrzostw. 28 grudnia 2015 poinformowano, że ostatecznie wszystkich formalności związanych z procesem składania aplikacji dopełniła tylko strona polska, a Bydgoszcz pozostała jedynym kandydatem.