Związał się z Katarzyną Gójską-Hejke (byłą żoną Krzysztofa Hejkego), z którą ma trzy córki: Leonię (ur. 2014), Zofię (ur. 2016) i Antoninę (ur. 2020), a 29 kwietnia 2017 oboje wzięli ślub kościelny. Mieszka na wsi na Mazowszu. Zadeklarował się jako katolik.
Poglądy Michał Rachoń uznaje się za publicystę i dziennikarza. Zaprotestował przeciw określaniu go politykiem mimo jego wieloletniej działalności partyjnej w PiS, w tym pełnieniu funkcji rzecznika politycznego. Jak przyznał, kształtowanie swoich poglądów zawdzięcza Jerzemu Targalskiemu.