Eliminacje do Mistrzostw Europy U-21 w piłce nożnej rozpoczęły się 17 sierpnia 2004, a zakończyły się 12 października 2005. Wyłoniły osiem drużyn, które zagrali w turnieju finałowym w dniach 23 maja – 4 czerwca 2006 w Portugalii.
System rozgrywek 48 drużyn narodowych przystąpiło do rozgrywek. Najpierw zostały podzielone na 8 grup – sześć grup po 6, jedna grupa po 7 i jedna grupa po 5 zespołów (każdy zespół grał jeden mecz w domu i na wyjeździe). Mistrzowie i wicemistrzowie grup awansowali do fazy play-off, z której zostały wyłonionych ośmioro finalistów turnieju głównego.
W przypadku równej liczby punktów, zespoły są klasyfikowane według następujących zasad. liczba punktów zdobytych w meczach między tymi drużynami różnica bramek strzelonych w meczach tych drużyn liczba strzelonych bramek gole na wyjeździe.
Jeśli mimo wszystko dwie lub więcej drużyn jest z tą samą liczbą punktów, rozstrzygają kolejno: różnica wszystkich strzelonych i straconych goli liczba strzelonych goli liczba goli na wyjeździe gra fair playhttp://www.uefa.com/MultimediaFiles/Download/Regulations/competitions/Under21/84/52/29/845229_DOWNLOAD.pdf Regulations of the UEFA European Under-21 Championship