W latach 2003–2008 Debra Fischer przewodniczyła międzynarodowemu zespołowi N2K Consortium, który zajmował się poszukiwaniem gorących jowiszów wokół gwiazd o dużej metaliczności.
Była także jednym z założycieli Planet Hunters – uruchomionego w 2010 obywatelskiego programu poszukiwania planet pozasłonecznych na podstawie danych przesłanych przez Kosmiczny Teleskop Keplera. Jest on częścią większego programu Zooniverse.
Fischer, wraz ze swoimi współpracownikami z Uniwersytetu Yale, zajmuje się konstruowaniem coraz bardziej precyzyjnych instrumentów do wykrywania planet pozasłonecznych (spektrometr CHIRON zainstalowany w Międzyamerykańskim Obserwatorium Cerro Tololo w 2012, EXPRES skonstruowany dla Discovery Channel Telescope). Jej zespół pracuje także nad nowatorskimi technikami kalibracji długości fali, które mają umożliwić wykrywanie planet wielkości Ziemi.
Fischer została członkiem, powołanej przez NASA w 2015, inicjatywy NExSS (Nexus for Exoplanet System Science), której celem jest poszukiwanie życia na planetach pozasłonecznych.
Jest współautorką ponad dwustu prac naukowych.
Nagrody i wyróżnienia W 2002 Fischer i jej zespół otrzymali nagrodę Carl Sagan Memorial Award.