Filipinomysz krótkoogonowa (Apomys banahao) – gatunek ssaka z podrodziny myszy (Murinae) w obrębie rodziny myszowatych (Muridae), występujący endemicznie w prowincji Quezon na Filipinach w wysokich partiach góry Banahaw.
Taksonomia Gatunek po raz pierwszy zgodnie z zasadami nazewnictwa binominalnego opisał w 2011 roku amerykańsko-filipiński zespół zoologów (Amerykanie – Lawrence R. Heaney, Eric A. Rickart, Lawren VandeVrede i Scott J. Steppan oraz Filipińczycy – Danilo S. Balete, Phillip A. Alviola, Mariano Roy M. Duya, Melizar V. Duya i M. Josefa Veluz) nadając mu nazwę Apomys (Megapomys) banahao. Holotyp pochodził z barangayu Lalo (), na wysokości 1465 m n.p.m., na górze Banahaw, w prowincji Quezon, na wyspie Luzon, w Filipinach. Holotyp (o numerze 178501 FMNH) stanowi dorosły samiec schwytany w 9 maja 2006 roku przez Erica A. Rickarta i przechowywany jest w Muzeum Historii Naturalnej w Chicago.
Apomys brownorum należy do podrodzaju Megapomys. A. banahao jest najbliżej spokrewniony z A. brownorum. Na średnich wysokościach na górze Banahaw jest sampatryczny z A. magnus, a w szerszym zakresie wysokości z A. microdon i A. musculus.