Po odejściu Doktor dowiedział się, że Amy zaczęła pracować jako modelka i stała się popularna. Finał 6. serii przedstawia alternatywny świat stworzony przez River, w którym Amy przewodniczy tajnej organizacji, która walczy z Zakonem Ciszy, a później zabija Madame Kovarian. Po przywróceniu właściwego świata, River odwiedza Amy i Rory’ego, by powiedzieć im, że Doktor jednak przeżył.
Doktor około 2 lata po tych wydarzeniach odwiedza Amy i Rory’ego w święta. Po tym Doktor przez pewien czas nie odwiedzał Amy i Rory’ego. Wówczas Amy ukrywała przed Rorym, że przez wydarzenia w Demons Run nie może mieć dzieci, a wiedziała, że on chce mieć je, dlatego, nie wytłuszczając dlaczego, po prostu odeszła od niego. W pewnym momencie Doktor, a także Amy i Rory zostali uprowadzeni przez Daleków, by im pomóc. Podczas tej przygody Amy zwierza się Rory’emu z powodu ich rozstania, a także ma pretensje do Doktora o to, że przestał ich odwiedzać. Skutkiem tego był powrót Amy i Rory’ego do siebie, a także to, że Doktor ponownie zaczął odwiedzać ich i zabierać ich w kolejne przygody. Odwiedzili m.in. opuszczony statek kosmiczny Silurian, na którym są dinozaury oraz miasteczko Mercy. Byli także świadkami inwazji małych, czarnych sześcianów, które po pewnym czasie spowodowały śmierć wielu milionów ludzi.