Powstające przy tej okazji syntezy cząstkowe i prace monograficzne są publikowane jako samodzielne pozycje książkowe w odpowiednich seriach wydawniczych, czasopismach krajowych i zagranicznych.
Podstawę działalności naukowej i wydawniczej Ośrodka tworzą serie wydawnicze:
Geografia Historyczna Kościoła w Polsce, Dzieje Chrześcijaństwa Polski i Rzeczypospolitej Obojga Narodów, Prace Ośrodka Badań nad Geografią Historyczną Kościoła w Polsce KUL, Materiały Źródłowe do Dziejów Kościoła w Polsce, Studia nad Historią Kościoła Katolickiego w Polsce, Materiały do Atlasu Historycznego Chrześcijaństwa w Polsce, Biblioteka Historii Społeczno-Religijnej Ośrodka Badań nad Geografią Historyczną Kościoła w Polsce, Studia i Materiały do Historii Chrześcijaństwa w Polsce.