Dwa dni później o 10:27 UTC nastąpiło połączenie z Międzynarodową Stacją Kosmiczną, gdy Progress zadokował do portu cumowniczego w module Pirs.
1 lipca 2016 roku wykonano test systemu TORU, który umożliwia astronautom ręczne sterowanie statkiem podczas jego dokowania do stacji i jest urządzeniem rezerwowym na wypadek awarii systemu automatycznego. W tym celu Progress odcumował od ISS o 05:36 UTC i oddalił na ok. 200 m od stacji. Od tego momentu kosmonauci Aleksiej Owczynin i Oleg Skripoczka znajdujący się w module Zwiezda, wykorzystując parę specjalnych dżojstików konsoli TORU, manualnie sterowali statkiem podczas jego zbliżania się do stacji, bazując na obrazie z kamery. Gdy statek transportowy zbliżył się na kilka metrów do stacji, astronauci zameldowali kontroli misji o problemie z systemem TORU. Kontrola misji zaleciła przełączenie procedury na automatyczną. Następnie podczas dokowania statku nastąpiło niesankcjonowane użycie jednego z silników odpowiedzialnego za zmianę wysokości statku. Jako że Progress był już w fazie końcowej dokowania, błąd ten nie spowodował znaczących problemów i procedura zakończyła się o 06:04 UTC.