Wspomnienie o Hellmayrze ukazało się wpierw na łamach The Ibis.
Upamiętnienie Hellmayr upamiętnił swoją żonę w nazwie Calospiza gyroloides catharinae (Hellmayr, 1911) – obecnie tangarka rudogłowa (Tangara gyrola podg. catharinae).
Hellmayra upamiętnia 37 nazw naukowych ptaków i jedna nazwa rodzaju (stan w 2009), m.in.: Hellmayria Poche, 1904 = Pyrrhocorax Vieillot, 1816 Anthus hellmayri – świergotek trawny Attila rufus hellmayri – rudoturan siwogłowy podg. hellmayri Campylorhamphus trochilirostris hellmayri – drzewiarz czerwonodzioby podg. hellmayri Catharus fuscater hellmayri – drozdek szarogrzbiety podg. hellmayri Cranioleuca hellmayri – moczarnik kolumbijski Synallaxis hellmayri – ogończyk rdzawobarkowy Mecocerculus hellmayri – andotyranek boliwijski Rhynchocyclus brevirostris – oliwiak okularowy podg. hellmayri Empidonax occidentalis hellmayri – empidonka kordylierska podg. hellmayri Myiozetetes cayanensis hellmayri – bentewi złotociemeniowy podg. hellmayri.