Estonia na Letnich Igrzyskach Olimpijskich 2016 – czterdziestopięcioosobowa reprezentacja Estonii na Letnich Igrzyskach Olimpijskich 2016 w Rio de Janeiro. Występ w 2016 roku to 7. start reprezentacji Estonii na letnich igrzyskach olimpijskich. Podczas ceremonii otwarcia chorążym reprezentacji był żeglarz – Karl Martin Rammo.
Medaliści Medal Zawodnik Dyscyplina Data Wioślarstwo 11 Sierpnia
Skład reprezentacji 30px|alt=|link= Badminton
Mężczyźni ZawodnikKonkurencjaFaza grupowa1/8 finałuĆwierćfinałyPółfinałyFinałPozycjaPrzeciwnicyWynikPozycjaPrzeciwnikWynikPrzeciwnikWynikPrzeciwnikWynikPrzeciwnikWynikRaul MustGra pojedyncza Jørgensen; P 0-2 (8:21 15:21) Leverdez P 1-2 (18:21 21:18 12:21)3.colspan=4 17.-41.
Kobiety ZawodnikKonkurencjaFaza grupowa1/8 finałuĆwierćfinałyPółfinałyFinałPozycjaPrzeciwnicyWynikPozycjaPrzeciwnikWynikPrzeciwnikWynikPrzeciwnikWynikPrzeciwnikWynikKati TolmoffGra pojedyncza Yip P Y;