Zwycięzcy dwumeczów awansowali do fazy grupowej. Faza grupowa: w fazie grupowej drużyny zostały podzielone na 4 grupy po 4 drużyny. Najlepsze dwie drużyny awansowały do ćwierćfinałów. Faza pucharowa: składała się z 1/4 finału. Turniej finałowy: uczestniczyli w nim będą zwycięzcy ćwierćfinałów i składała się będzie z półfinałów, meczu o 3. miejsce oraz finału. Od 1 lipca 2016 weszły w życie przepisy dotyczące m.in. stosowania niebieskich kartek. We wszystkich zawodach pod rozgrywanych pod egidą EHF otrzymanie przez zawodnika bezpośrednio traktowane jest jak otrzymanieInformacje uzyskane e-mail'em od p. JJ Rowland - Head of Media and Communications European Handball Federation w dn. 12 września 2016.. W protokołach meczowych winno być zaznaczane jako D (dyskwalifikacja) oraz TP (kara zespołowa), lecz pomimo oficjalnego stanowiska EHF sędziowie w trakcie rozgrywek pokazują bez opisywania ich w protokole przyjmując gradację kar.
Rundy kwalifikacyjne
Pierwsza runda kwalifikacyjna Rozstawionymi zespołami w losowaniu było pierwszych 15 drużyn z zestawienia EHF uczestniczących w pierwszej rundzie kwalifikacyjnej i w toku losowania zostały połączone w pary z pozostałymi 15 drużynami.
W dwumeczu pomiędzy US Créteil Handball a RK Zamet wystąpił remis, awans wywalczył zespół, który strzelił więcej bramek na wyjeździe.