Poza działem historii oraz pierwszego okresu po drugiej wojnie światowej, wszystkie mapy ludnościowe i gospodarcze zostały uaktualnione, głównie według wyników Narodowego Spisu Powszechnego i Powszechnego Spisu Rolnego z roku 2002.Struktura treści II wydania atlasu:
Część fizyczno-geograficzna, zawierająca 281 map Położenie, administracja, krajobrazy 19 map Geologia i fizyczne cechy powierzchni Ziemi 24 mapy Gleby 11 map Wody, klimat 82 mapy Roślinność, zwierzęta 75 map Zagospodarowanie środowiska, górnictwo, stan i zagrożenie środowiska 70 map Część historyczna i społeczno - gospodarcza, zawierająca 222 mapy Historia, integracja, migracje 67 map Ludność, cechy demograficzne ludności, urbanizacja, poziom życia 55 map Rolnictwo i leśnictwo 47 map Przemysł, transport 14 map Usługi, oświata i wychowanie, ochrona zdrowia, opieka społeczna, nauka i kultura, turystyka 37 map Budżety gmin 2 mapy
Wydanie trzecie Opracowanie trzeciego wydania zostało zawieszone na czas nieokreślony ze względu na likwidację Pracowni Atlasu Dolnego Śląska jako czynnej jednostki organizacyjnej Uniwersytetu Wrocławskiego.