Krytycy podejścia EMDR uważają, że wiele aspektów terapii EMDR, jak ekspozycja na bodziec związany z wydarzeniem traumatycznym czy techniki relaksacyjne są zapożyczone z innych metod stosowanych w terapii stresu traumatycznego i to właśnie one wpływają na skuteczność terapii. Mc NellieMc Nally R.J. (1999) « On eye movements and animal magnetism: A reply to Greenwald’s defense of EMDR » Journal of Anxiety Disorders, 13, 617–620. uważa, na przykład, że słynne ruchy gałek ocznych nie przynoszą żadnych specyficznych efektów i że terapia nic nie zyskuje dzięki temu elementowi, podsumowuje to zdanie: „To co działa w terapii EMDR nie jest nowe, a to co jest nowe, nie działa”.
EMDR jest rekomendowane przez uznane instytucje międzynarodowe, między innymi Światową Organizację Zdrowia (sierpień 2013 rokuL’OMS publie des orientations sur les soins de santé mentale après un traumatisme » sur Organisation mondiale de la santé, 2013.), Amerykańskie Towarzystwo Psychiatryczne (2004)American Psychiatric Association (2004) Practice Guideline for the Treatment of Patients with Acute Stress Disorder and Posttraumatic Stress Disorder., amerykańskie Ministerstwo Obrony i Ministerstwo Lecznictwa dla Weteranów (2004)Department of Veterans Affairs & Department of Defense (2004)..