Doustne leki przeciwpłytkowe (współautor wraz z Krzysztofem Filipiakiem oraz Janiną Stępińską), Termedia Wydawnictwa Medyczne, Poznań 2006, Interwencyjne leczenie przewlekłych niedrożności tętnic. Przełom w kardiologii inwazyjnej (redaktor wraz z Leszkiem Bryniarskim), wyd. Exemplum, Poznań 2009, Ostre zespoły wieńcowe. Możliwości diagnostyczne i terapeutyczne (redaktor wraz z Robertem Gilem), Termedia Wydawnictwa Medyczne, Poznań 2015, ponadto rozdziały w podręcznikach oraz prace publikowane w takich czasopismach jak m.in. „International Journal of Cardiology”, „The Lancet”, „Circulation”, „Journal of the American College of Cardiology”, „European Heart Journal” oraz „EuroIntervention”.
Kontrowersje Sprawa śmierci Jerzego Ziobry 22 czerwca 2006 roku do Szpitala Uniwersyteckiego w Krakowie w związku z chorobą kardiologiczną trafił Jerzy Ziobro, ojciec ówczesnego ministra sprawiedliwości Zbigniewa Ziobry. Zabieg na sercu pacjenta przeprowadził Dariusz Dudek. Mimo pozytywnego przebiegu operacji, Jerzy Ziobro zmarł 2 lipca 2006 roku.