Zdobył także siedem bramek, z których pierwszą 25 kwietnia 2008 w meczu ligowym przeciwko NSÍ Runavík (1:0).
10 czerwca 2010 roku ogłoszono podpisanie kontraktu Gregersena z klubem Ross County, rozgrywającym wówczas mecze w drugiej lidze szkockiej. Zadebiutował on w meczu Pucharu Ligi przeciwko Dundee United (1:2), jednak było to jedyne rozegrane przez niego spotkanie dla klubu i pod koniec roku zdecydował się na powrót na Wyspy Owcze.
Od sezonu 2011 ponownie jest zawodnikiem Víkingura Gøta. Dotychczas od powrotu ze Szkocji wystąpił w stu osiemdziesięciu dwóch meczach i zdobył jedenaście bramek. Klub nie osiągnął w tym czasie mistrzostwa kraju, zdobywając najwyżej trzecią pozycję w tabeli (2009, 2011, 2014 oraz 2015). Triumfowali jednak w rozgrywkach pucharowych, zdobywając Puchar Wysp Owczych czterokrotnie (2009, 2012, 2013 i 2015). W sezonie 2016 jego klub po raz pierwszy zdobył tytuł Mistrza Wysp Owczych.
Kariera reprezentacyjna Atli Gregersen po raz pierwszy reprezentował swój kraj w rozgrywkach U-17 4 sierpnia 1998 roku w meczu przeciwko Szwecji (0:3). Łącznie wystąpił w siedmiu meczach na tym poziomie wiekowym. Grał także w reprezentacji U-19, gdzie wystąpił pięć razy. Zadebiutował w meczu przeciwko Albanii 27 września 1999 (1:3).