Jednocześnie nakazał używanie w stosunku do kierowników komisariatów i placówek nowych terminów: „komendant komisariatu” i „dowódca placówki”. Komisariat wszedł w skład struktury Obwodu Straży Granicznej „Przasnysz”. Rozkazem nr 2 z 16 stycznia 1939 w sprawie przejęcia odcinka granicy polsko-niemieckiej od Korpusu Ochrony Pogranicza na terenie Mazowieckiego Okręgu Straży Granicznej oraz przekazania Korpusowi Ochrony Pogranicza odcinka granicy na terenie Wschodniomałopolskiego Okręgu Straży Granicznej, komendant Straży Granicznej płk Jan Gorzechowski wydzielił komisariat „Myszyniec” z Obwodu SG „Przasnysz” i przydzielił go do Obwodu SG „Łomża”. Rozkazem KGSG nr 12/39, z dniem 1 VII 1939 zniesiono placówkę II linii „Ostrołęka” i posterunek SG „Goniądz”
Służba graniczna Sąsiednie komisariaty': komisariat Straży Granicznej „Kolno” ⇔ komisariat Straży Granicznej „Chorzele” − 1928 komisariat Straży Granicznej „Leman” ⇔ komisariat Straży Granicznej „Krukowo” − październik 1929
Działania w 1939