100 m stylem motylkowym mężczyzn – jedna z konkurencji, które odbyły się podczas Mistrzostw Świata w Pływaniu na krótkim basenie 2016. Eliminacje i półfinały miały miejsce 7 grudnia, a finał 8 grudnia.
Po raz trzeci z rzędu mistrzem świata został reprezentant Republiki Południowej Afryki Chad le Clos, który czasem 48,08 poprawił swój rekord świata o 0,36 s. Srebrny medal wywalczył Amerykanin Tom Shields (49,04). Brąz zdobył David Morgan z Australii, ustanawiając nowy rekord Australii i Oceanii (49,31).
Rekordy Przed zawodami rekordy świata i mistrzostw wyglądały następująco: RekordZawodnikCzasMiejsceDataRekord świata Chad le Clos 48,44 Doha 4 grudnia 2014Rekord mistrzostw świata Chad le Clos 48,44 Doha 4 grudnia 2014
W trakcie zawodów ustanowiono następujące rekordy: DataEtap konkurencjiZawodnikCzasRekord 8 grudnia finał Chad le Clos 48,08 , CR