W ciągu kolejnych 7 dni HTV-6 miał wykonywać eksperyment z uwięzią elektrodynamiczną, jednak 31 stycznia media podały informację o problemach z rozwinięciem uwięzi, co doprowadziło do uznania eksperymentu za nieudany.
5 lutego 2017 pojazd wykonał trzy zapłony silników głównych, doprowadzające do jego kontrolowanej deorbitacji. HTV-6 spłonął w atmosferze około godziny 15:06 UTC.
Ładunek Statek HTV-6 wyniósł na orbitę ładunek o masie 5900 kg. W sekcji hermetycznej znajdowało się 3900 kg zaopatrzenia, w tym: specjalny dyspenser do umieszczania nanosatelitów w przestrzeni kosmicznej, 7 CubeSatów do umieszczenia w przestrzeni kosmicznej, system chłodzenia wnętrza stacji do przetestowania na ISS, Dozymetr do wyposażenia modułu Kibō, dwie kamery wysokiej rozdzielczości (4K i 2K) z możliwością rejestracji obrazu w nocy do umieszczenia na odsłoniętej platformie Kibō, system do oczyszczania powietrza stacji z dwutlenku węgla, 600 litrów wody pitnej dla załogi, pożywienie dla członków stałej załogi ISS.