W 1958 roku Andrzej Grodek przygotował projekt reorganizacji uczelni z zachowaniem jej akademickiego charakteru, jednak jej wdrożenie przerwała jego śmierć.
Andrzej Grodek był dwukrotnie żonaty. Ze związku z Marią Antoniną z Morawskich (1899–1968) miał dwie córki: Annę Marię (1932–1988) oraz Zofię Apolonię (ur. 1942). Po rozwodzie pojął za żonę Marię Kazimierę z Królikowskich (1904–1985).
Zmarł w Warszawie, pochowany na cmentarzu Wojskowym na Powązkach (kwatera B 2-13-15).
W 1963 roku pośmiertnie opublikowano wybór pism Andrzeja Grodka wraz z pełną bibliografią pracH. Uniejewska, A. Miłaszewska, Bibliografia prac prof. dr Andrzeja Grodka, [w:] Andrzej Grodek, Wybór pism, tom II, Studia nad Rozwojem Kapitalizmu w Polsce, Warszawa 1963, s. 469–484..
Materiały archiwalne Andrzeja Grodka znajdują się w PAN Archiwum w Warszawie pod sygnaturą III-81Spis inwentarzy, Polska Akademia Nauk Archiwum w Warszawie, [dostęp 2024-02-28]..