Prefektura apostolska Zhaotong (łac. Apostolica Praefectura Chaotungensis, chiń. 天主教昭通监牧区) – rzymskokatolicka prefektura apostolska ze stolicą w Zhaotong, w prowincji Junnan, w Chińskiej Republice Ludowej.
Historia 8 kwietnia 1935 z mocy decyzji Piusa XI wyrażonej w bulli Ad christianum erygowano prefekturę apostolską Zhaotong. Dotychczas wierni z tych terenów należeli do wikariatu apostolskiego Junnanu (obecnie archidiecezja Kunming).
Od zwycięstwa komunistów w chińskiej wojnie domowej w 1949 prefektura apostolska, podobnie jak cały prześladowany Kościół katolicki w Chinach, nie może normalnie działać. Prefekt apostolski ks. Stephan Fan Kaiping uciekł z kraju. W 1988 prefektem został kapłan Patriotycznego Stowarzyszenia Katolików Chińskich i dotychczasowy wikariusz generalny ks. Chen Mushun. Przyjął on sakrę biskupią, choć zazwyczaj prefekci apostolscy nie są biskupami. Jego wybór uznał rząd w Pekinie. Na początku swej posługi biskupiej był jedynym kapłanem katolickim w prefekturzeucanews.com.