Został członkiem Royal Institution w 1817 roku, a w listopadzie 1825 roku wybrano go na członka Towarzystwa Linneuszowskiego. Od roku śmierci J.R. Forstera (1849) był skarbnikiem oraz wiceprzewodniczącym tego towarzystwa. Był też jednym z pierwszych członków założonego w 1826 roku Towarzystwa Zoologicznego, w którym działał jako przyrodnik i człowiek biznesu oraz Entomological Society of London.
Zmarł w Great Yarmouth 1 września 1856 roku. Został pochowany na rodzinnej części cmentarza w Bayford i upamiętniony w St. James’s Church Piccadilly marmurową tablicą z portretem w medalionie wspieranym przez dwa łabędzie, co przypomina jego miłość do ptaków, a szczególnie upamiętnia odkrycie nowego podgatunku łabędzi, nazwanego – na cześć Thomasa Bewicka – Cygnus columbianus bewickii (Yarrel, 1830, łabędź czarnodzioby). Zachowane są inne portrety: portret nieznanego autorstwa, będący w posiadaniu prof. Newtona (Cambridge), miniaturowa akwarela, wykonana przez panią Waterhouse Hawkins, litografia w „Ipswich series” (uczczenie spotkania British Association w Ipswich, 1849), grawerska kopia (zob. klisza) zdjęcia z roku 1855 (fot. Maull & Polyblank).
Darwin, który otrzymał wiadomość o śmierci W. Yarrella od W.B.