Na przestrzeni lat struktura organizacyjna BG podlegała różnym zmianom. W początkowym okresie (1945–1955) na czele biblioteki stał kierownik, który zarządzał podległymi mu pracownikami. Było to o tyle łatwe, że do roku 1952 nie istniały wyodrębnione działy. W marcu 1955 roku został mianowany pierwszy dyrektor BG, Donat Kotowicz. Dyrektor biblioteki automatycznie wchodził w skład Senatu PW. Powołana też została Senacka Komisja Biblioteczna, która odpowiadała za koordynowanie działalności biblioteki z działalnością uczelni, politykę gromadzenia zbiorów i opiniowała plany rozwojowe biblioteki. W latach 1945–1953 BG miała charakter zamknięty, zbiory były przeznaczone tylko dla kadry naukowej i studentów PW. W 1953 roku na podstawie Załącznika do Zarządzenia nr 76 Ministerstwa Szkolnictwa Wyższego BG PW stała się biblioteką naukową o charakterze publicznym.