Spotyka się też z Kleopatrą, ostrzegając ją, że jeżeli nie będzie sprawiedliwą władczynią, powróci, żeby zabić też ją. Bayek i Aya, którzy przybrali imiona Amun i Amunet, rozpoczynają werbowanie i szkolenie kolejnych ukrytych, tworząc struktury bractwa w – odpowiednio – Egipcie i RzymieIbid., zadania: „Ostateczna rozgrywka”, „Ostatni z medżajów”..

W roku 2017 pracowniczka Abstergo Industries, Layla Hassan, otrzymuje zadanie odzyskania dla firmy artefaktów z Egiptu. Zamiast nich w grobowcu znajduje mumie Bayeka i Ayi. Mając nadzieję na odkrycie informacji, które zapewnią jej pozycję w projekcie Animus, wykorzystuje zmodyfikowaną przez siebie wersję urządzenia, żeby przeżyć wspomnienia odnalezionego małżeństwa. Będąc w animusie, Layla może natknąć się na struktury wzniesione przez Pierwszą Cywilizację, zawierające wiadomości wskazujące, że odegra ona ważną rolę w nadchodzącym wydarzeniu o apokaliptycznej skali. Kiedy nie melduje się do Abstergo, firma wysyła za nią zabójców, jednak udaje jej się ich pokonać. Wraca do animusa, z którego zostaje wybudzona przez Williama Milesa, mentora asasynów. Layla zgadza się współpracować z bractwem, ale odmawia przyłączenia się do niego.