Po przegranej bitwie pod Połtawą we wsi przebywał w latach 1709-1713 król Szwecji Karol XII, który rozbił w tym miejscu obóz wojskowy nazwany drugim Sztokholmem, a także jego kozaccy, mołdawscy i polscy sojusznicyZbigniew Anusik, Karol XII, Wrocław 2006, ss. 294-300, m.in. Iwan Mazepa, który w Varnițy zmarł. W 1925 r. na prośbę władz Szwecji wzniesiono w tym miejscu pamiątkowy obelisk. Odrębny pomnik upamiętnia postać Mazepy.
We wsi znajduje się port rzeczny na Dniestrze, który w 2006 r. stał się przedmiotem sporu między Mołdawią i Naddniestrzem. W 2006 r. strony ogłosiły chęć rozstrzygnięcia sporu na drodze sądowej, a władze w Naddniestrzu ogłosiły, że do momentu wydania wyroku kontrolę nad infrastrukturą portową powinny sprawować siły pokojowe stacjonujące od 1992 r. w Naddniestrzu (głównie Rosjanie). Po wejściu żołnierzy do Varnițy sprawą zainteresowała się ambasada Stanów Zjednoczonych w Kiszyniowie, apelując o zwrot portu Mołdawii. Także Unia Europejska wezwała obie strony do spokoju i nieeskalowania konfliktu. Ostatecznie mołdawski sąd stwierdził, że port stanowi własność władz lokalnychJ. Solak, Mołdawia..., s. 135.. Incydent wokół portu został sztucznie rozdmuchany przez obie strony, którym zależało na utrzymaniu zainteresowania organizacji międzynarodowych sprawą Naddniestrza. W 2013 r.