W początkach XIX wieku odbudowana została z ruin , zniszczona w czasie rewolucji francuskiej. Odbudowę zapoczątkował ksiądz , który odpowiedział rzekomo na wezwanie Boga. W czasie wojen napoleońskich, cesarz zgromadził w Boulogne swą Wielką Armię przygotowując się do niedoszłej inwazji na Wielką Brytanię w roku 1805. Jego plany nigdy nie zostały zrealizowane wobec konieczności wykorzystania Wielkiej Armii na innym teatrze działań zbrojnych w Europie oraz wobec przewagi Royal Navy na morzu.
15 czerwca 1944 roku 297 bombowców (155 Avro Lancaster, 130 Handley Page Halifax i 12 De Havilland Mosquito) RAF-u zaatakowało port w Boulogne, by zminimalizować zagrożenie floty desantowej w Normandii ze strony Kriegsmarine po D-Day. Część Lancasterów była uzbrojona w ciężkie bomby typu Tallboy. Na skutek bombardowania port i otaczające go dzielnice uległy całkowitemu zniszczeniu. W sierpniu 1944 miasto, zgodnie z wolą Hitlera, zostało zamienione w „twierdzę”, ale miesiąc później zostało wyzwolone przez . Kanadyjczykom pomogli mieszkańcy miasta, którzy wskazali żołnierzom sekretne przejście wiodące poza średniowieczne mury miejskie, a co za tym idzie na tyły Niemców.