Baltimore Bays – amerykański klub piłkarski z Baltimore w stanie Maryland. Drużyna występowała w najpierw w lidze NPSL (1967), potem w lidze NASL (1968–1969), a jego domowymi obiektami były Memorial Stadium oraz Kirk Field. Zespół istniał w latach 1967–1969.
Historia Klub został założony w 1967 i przystąpił rozgrywek ligi NPSL, w którym zdobył wicemistrzostwo po porażce w finale z Oakland Clippers. Następnie po połączeniu lig NPSL i USA w ligę NASL. Właścicielem klubu był Jerold Hoffberger, prezes National Brewing Company (producent piwa) oraz właściciel klub baseballowej ligi Major League Baseball – Baltimore Orioles.
W sezonie 1968 zespół zajął 4. miejsce w Dywizji Atlantyckiej i nie zakwalifikował się do fazy play-off. Natomiast sezon 1969 składał się z dwóch części: Pucharu Interkontynentalnego – w którym kluby były reprezentowane przez piłkarzy klubów angielskich, a Baltimore Bays był reprezentowany przez piłkarzy West Ham United i zajął 2. miejsce oraz sezonu zasadniczego, w którym klub zajął 5. miejsce i ponownie nie zakwalifikował się do fazy play-off. Po zakończeniu sezonu 1969 klub został rozwiązany.