Prawo antydyskryminacyjne przyjęte w 2009 nie uwzględnia tożsamości płciowej, choć zakładano to przez wprowadzeniem ustawy. Cechy płciowe nie są pojęciem objaśnionym w ustawie, podobnie jak termin orientacja seksualna. Choć ustawa zakazuje „wszelkiego reprezentowania i zachęcania do postaw rasistowskich, antyreligijnych i przeciwnych innym narodowościom”, to nie zabrania mowy nienawiści przez wzgląd na orientację seksualną i tożsamość płciową (artykuł czwarty).
W kwietniu 2016 bośniacki parlament przyjął poprawki do Kodeksu Karnego, zakazując przestępstw z nienawiści motywowanych orientacją seksualną i tożsamością płciową. 15 czerwca 2016 przyjęte zmiany zostały opublikowane w dzienniku ustaw. Podobne zakazy istniały już wcześniej w Republice Serbskiej i Dystrykcie BrczkoFederation of BiH finally adopts hate crime regulation..
W lipcu 2016 parlament Bośni i Hercegowiny przyjął ustawę wprost zakazującą dyskryminacji ze względu na orientację seksualną, tożsamość płciową i cechy płcioweBetter protection of LGBTI persons through the amendments to the Anti-discrimination Law of BiH.Anti-discrimination law updated – great step forward in Bosnia and Herzegovina..
Azyl Prześladowanie z uwagi na orientację seksualną nie jest prawnie uznane za czynnik gwarantujący status uchodźcy.