Zadaniem tej organizacji było oszacowanie całkowitej wartości strat wojennych Polski powstałych w wyniku okupacji niemieckiej ziem polskich w latach 1939–1945Z przyczyn politycznych – faktycznej okupacji powojennej Polski przez Armię Czerwoną – biuro nie zajęło się oszacowaniem strat spowodowanych radziecką okupacją ziem polskich.. Biuro prowadziło działalność do 1 kwietnia 1947 r., gdy na mocy uchwały Rady Ministrów z 9 stycznia 1947 r. zostało zlikwidowane. Jego zadania w kwestii strat w gospodarce przejął Centralny Urząd Planowania, a w zakresie szkód prywatnych Ministerstwo Administracji Publicznej.
Działalność urzędu Biuro było naczelną instytucją sprawującą kontrolę nad swoimi filiami przy innych ministerstwach oraz własnymi placówkami terenowymi, których zadaniem było zinwentaryzowanie oraz rejestracja zniszczeń i strat. Niezależnie od własnej struktury organizacyjnej Biuro Odszkodowań Wojennych współpracowało również z urzędami miejskimi i gminnymi, jednostkami samorządowymi, organizacjami zawodowymi i instytucjami jak Powszechny Zakład Ubezpieczeń Wzajemnych itp..