Kościół św. Franciszka z Asyżu () – rzymskokatolicki kościół zbudowany w Victorii na Gozo, Malta, stojący na Pjazza San Franġisk. Do budynku kościoła przylega klasztor Franciszkanów Konwentualnych.
Historia Data powstania pierwszego klasztoru i kościoła św. Franciszka sięga wstecz roku 1492. Pierwszy kościół był poświęcony św. Markowi. Dedykacja kościoła została zmieniona na św. Franciszka z Asyżu w roku 1535r. Aktualnie istniejący kościół i klasztor zbudowane zostały w większości w XVII wieku. Budowę kościoła ukończono w roku 1663. Wielki Mistrz Antonio Manoel de Vilhena odwiedził klasztor i kościół w roku 1742. Zatrzymał się tutaj w dniach 5 do 9 czerwca.
W grudniu 1890 roku, na rozporządzenie rządu, kościół został zamknięty dla publicznego dostępu, kiedy okazało się, że stan jego sklepienia zagraża bezpieczeństwu osób w nim przebywających. Sufit oraz fasada zostały przebudowane, i kościół ponownie otwarto 16 kwietnia 1893 roku. W dniu 11 listopada 1906 roku biskup Gozo Giovanni Maria Camilleri konsekrował kościół.
Budynek kościoła umieszczony jest na liście National Inventory of the Cultural Property of the Maltese Islands.