Pierwszym Przewodniczącym Zarządu Głównego PTA, wybranym dwukrotnie w 1994 i 1998, był prof. Krzysztof Kula. W latach 2002–2006 i 2007-2011 Przewodniczącym był prof. Grzegorz Jakiel. 14 kwietnia 2011 r. Przewodniczącą została wybrana prof. Jolanta Słowikowska-Hilczer na lata 2011-2015, a następnie na lata 2016-2019.
Z okazji 20-lecia towarzystwa w 2014 wręczono Medale Zasłużonym dla Polskiego Towarzystwa Andrologicznego: prof. Krzysztofowi Kuli i prof. Grzegorzowi Jakielowi.
Członkostwo w PTA Towarzystwo liczy ponad 200 członków zwyczajnych.
Godność członka honorowego PTA nadano: prof. Emilowi Steinbergerowi (Huston, Texas, USA) w 1997 prof. Annie Steinberger (Huston, Texas, USA) w 1997 prof. Michałowi Bokińcowi w 2002 prof. Marianowi Semczukowi w 2007 prof. Leszkowi Bablokowi w 2011 prof. Dimitriosowi Adamopoulosowi (Ateny, Grecja) w 2011 prof. Ewie Rajpert-DeMeyts (Dania) w 2015 prof. Krzysztofowi Kuli w 2015