Opis Rozmiarami halszkaraptor był zbliżony do kaczki krzyżówki. Autorzy odkrycia stwierdzili szereg charakterystycznych cech budowy halszkaraptora, z których część była autapomorfiami. Kość przedszczękowa posiadała spłaszczony pysk, który stanowił 32% jej długości. Zawierała jedenaście zębów. Kość jarzmowa miała kształt pręta, a jej gałąź wstępująca tworzyła tylko 1/10 części obecnej za okolicą oczodołowej, nie dochodząc do samego oczodołu. Szyja była bardzo wydłużona, stanowiąc niemal połowę całkowitej długości ciała. Tylne wyrostki kręgów szyjnych (postzygapophyses) nie mają dodatkowych wyrostków (epipophyses) na ich górnej krawędzi. Kręgi szyjne miały skrajnie zredukowane wyrostki kolczyste (od 6. kręgu w dół nie mają ich w ogóle). W kręgach szyjnych od 2. do 5. zazwyczaj parzyste tylne wyrostki kręgów były połączone w jeden, płatowaty wyrostek. Wyrostki kolczyste kręgów ogonowych były również bardzo skrócone: na pierwszych trzech kręgach ogonowych miały postać niewielkich guzków, a kolejne kręgi ogonowe nie miały ich w ogóle. Szewrony u podstawy ogona były duże, o pięciokątnym przekroju. Pierwszy paliczek trzeciego palca stanowił 47% długości trzeciej kości śródręcza. W 2021 roku Cau i in. opisali jego kość widełkową, która była połączona z mostkiem.