Monitoring Ptaków Drapieżnych (MPD) – koordynowany przez Komitet Ochrony Orłów. Obejmuje monitoringiem 11 gatunków ptaków drapieżnych, oraz 1 gatunek ptaka brodzącego, tj.: trzmielojad Pernis apivorus kania ruda Milvus milvus kania czarna Milvus migrans bielik Haliaeetus albicilla jastrząb Astur gentilis myszołów Buteo buteo błotniak stawowy Circus aeruginosus błotniak łąkowy Circus pygargus orlik krzykliwy Aquila pomarina pustułka Falco tinnunculus kobuz Falco subbuteos bocian czarny Ciconia nigra W ramach programu prowadzona jest ocena wskaźnika liczebności gatunku oraz rozpowszechnienia gatunku oraz w przypadku bielika i orlika krzykliwego wskaźnika efektów rozrodu.
Monitoring Lęgowych Sów Leśnych (MLSL) – koordynowany przez Stowarzyszenie Ochrony Sów. Obejmuje monitoringiem 6 gatunków sów leśnych, tj.: puszczyk Strix aluco puszczyk uralski Strix uralensis uszatka Asio otus włochatka Aegolius funereus sóweczka Glaucidium passerinum puchacz Bubo bubo W ramach programu prowadzona jest ocena wskaźnika liczebności gatunku oraz rozpowszechnienia gatunku.