Sezon 1999/00 Drugiej ligi SR Јugoslavije – 8. edycja rozgrywek jugosłowiańskiej Drugiej ligi (srb. Дpугa caвeзнa лига – Druga savezna liga) w piłce nożnej.
Rozgrywki toczyły się w trzech grupach: Sjever (Północ), Zapad (Zachód) oraz Istok (Wschód) i występowało w nich łącznie 54 drużyn. Po zakończeniu sezonu mistrzowie każdej grupy awansowali bezpośrednio do Prvej ligi SR Јugoslavije, a ostatnie drużyny spadły do Srpskiej ligi.
Sjever (Północ) Drużyny
W Drugiej lidze w grupie Sjever w sezonie 1999/00 występowało 18 drużyn. Drużyna Miasto Sezon 1998/99 Uwagi Drużyny, które występowały w Drugiej lidze Istok SR Јugoslavije 1998/99: FK Zvezdara Belgrad Belgrad-Zvezdara 3. miejsce FK Dinamo Pančevo Pančevo 4. miejsce FK Kolubara Lazarevac Belgrad-Lazarevac 5. miejsce RFK Novi Sad Nowy Sad 6. miejsce FK ČSK Pivara Čelarevo Čelarevo 7. miejsce FK Mladost Apatin Apatin 8. miejsce FK Vrbas Vrbas 9. miejsce OFK Kikinda Kikinda 10. miejsce FK Radnički Belgrad Belgrad-Nowy Belgrad 11. miejsce FK Beograd Belgrad-Palilula 14. miejsce FK Bečej Bečej 16. miejsce FK Palilulac Belgrad Belgrad-Palilula 17. miejsce Drużyny, które awansowały z Srpskiej ligi 1998/99: FK BSK Borča Belgrad-Palilula 1. miejsce Srpska liga – Beograd FK Cement Beočin Beočin 1. miejsce Srpska liga – Vojvodina FK Big Bull Bačinci Bačinci 2.