W Drugiej lidze w grupie Zapad w sezonie 1999/00 występowało 18 drużyn. Drużyna Miasto Sezon 1998/99 Uwagi Drużyny, które występowały w Drugiej lidze Zapad SR Јugoslavije 1998/99: FK Bane Raška Raška 3. miejsce FK Zeta Golubovci Golubovci 4. miejsce FK Berane Berane 6. miejsce FK Rudar Pljevlja Pljevlja 7. miejsce FK Lovćen Cetinje Cetinje 8. miejsce FK Javor Ivanjica Ivanjica 9. miejsce FK Mladost Lučani Lučani 10. miejsce FK Novi Pazar Novi Pazar 11. miejsce FK Čelik Nikšić Nikšić 15. miejsce FK Sloboda Užice Užice 16. miejsce FK Sloga Kraljevo Kraljevo 18. miejsce Drużyny, które awansowały z Crnogorskiej ligi 1998/99: FK Mladost Podgorica Podgorica 1. miejsce Crnogorska liga FK Jedinstvo Bijelo Polje Bijelo Polje 2. miejsce Crnogorska liga FK Grbalj Radanovići Radanovići 3. miejsce Crnogorska liga FK Bokelj Kotor Kotor 4. miejsce Crnogorska liga FK Ibar Rožaje Rožaje 5. miejsce Crnogorska liga Drużyny, które awansowały z Srpskiej ligi 1998/99: FK Šumadija 1903 Kragujevac Kragujevac 1. miejsce Srpska liga – Morava FK Zlatibor Užice Užice 2.