Tam okazuje się, że przy pomocy specjalnego narkotyku Joseph był w stanie kontrolować przywódców ruchu oporu, po czym rozkazał ponownie porwać przyjaciół Zastępcy. Joseph daje graczowi wybór – może zabrać swoich kolegów z policji i odjechać z hrabstwa, lub się sprzeciwić i rozpocząć walkę z Seedem.
W przypadku wybrania pierwszej opcji, szeryf, Zastępca i inni policjanci odjeżdżają z Hope County. Projekt u Bram Edenu ponownie kontroluje cały obszar. Szeryf Whitehorse postanawia jednak nie odpuszczać i po wydostaniu się z hrabstwa postanawia wezwać na pomoc Gwardię Narodową. W trakcie jazdy w radiu samochodowym odtwarzany jest utwór „Only You” zespołu The Platters, która przez pranie mózgu przez Jacoba powoduje u Świeżego chęć zabijania.
Druga opcja spowoduje natychmiastową walkę pomiędzy graczem a Josephem i kontrolowanymi przez niego ludźmi. Zastępcy udaje się jednak wyrwać tych ludzi spod kontroli Josepha, dzięki czemu wspólnie udaje im się powstrzymać Ojca. Szeryf Whitehorse zamierza aresztować Seeda, jednak na horyzoncie niespodziewanie dochodzi do eksplozji bomby jądrowej, która prawdopodobnie była zwiastowaną przez Josepha katastrofą. Wszyscy starają się uciec samochodem do bezpiecznego miejsca. Dochodzi jednak do wypadku, w wyniku którego przeżywają jedynie Seed i gracz.