Przewód pokarmowy to prosta rurka, która rozpoczyna się od brzusznej strony głowy, a zakończona jest odbytem, położonym na granicy między tułowiem a ogonem po stronie brzusznej. W około otworu gębowego (określany jako vestibulum) występują zęby, papille zmysłowe (mechanoreceptory wraz z chemoreceptorami) i takie, które wydzielają śluz z gruczołów. W przestrzeni gębowej obecne są gruczoły, które wydzielają silnie działające neurotoksyny, konkretnie tetrodotoksyny, które pomagają paraliżować ofiarę. W innych źródłach mowa jest też o bakteriach symbiotycznych, które umożliwiają wytwarzanie tetrodotoksyny. Trucizny wydostają się z organizmu przez zęby strzałki morskiej. Przednia część przewodu pokarmowego jest usiana komórkami, które produkują enzymy trawienne, zaś tylna część w komórki absorbujące. W przedniej części jelita środkowego obejmuje dwa zachyłki jelitowe. Na zewnątrz od jednowarstwowego nabłonka typowego dla celomy obecna jest cienka warstwa wisceralnego nabłonka celomatycznego razem z miofilamentami, ułożonymi okrężnie. Przewód pokarmowy zawieszony jest na mezenteriach, grzbietowych i brzusznych.
Układów wydalniczego, krwionośnego czy oddechowego brak. Jama ciała jest wypełniona płynem, który przypuszczalnie spełnia tę samą funkcję, co układ krwionośny.