30 listopada 2005, na XXXVIII sesji Rady Powiatu została przyjęta zmodyfikowana pierwsza propozycja Marciniaka-Kożuchowskiego. Przyjętą flagę tworzyły trzy pionowe pasy: czerwony, srebrny, czerwony (przy pionowych flagach lub banerach pasy miały być poziome). Mogła również zawierać herb powiatu. W 2006, herb i flaga powiatu przyjęte przez Radę zostały zakwestionowane przez Komisję Heraldyczną, która dopatrzyła się w herbie odwołania do domniemanego pobytu templariuszy na ziemi prudnickiej, a także zakwestionowała historyczną postać Woka z Rożemberka. Marciniak-Kożuchowski, który za projekt otrzymał osiem tysięcy złotych, został pozwany przez prudnickie starostwo w 2008. mały|Flaga przed Starostwem Powiatowym w Prudniku Obecna flaga, autorstwa Wojciecha Drelicharza, Zenona Piecha oraz Barbary Widłak, została ustanowiona uchwałą nr XXXIII/224/09 z 29 maja 2009. Jest to prostokątny płat tkaniny o proporcjach 5:8, podzielony na trzy skosy: czerwony, biały i błękitny. W jego centralnej części umieszczono godło z herbu powiatu.