Howard odeszła od Scotta w 1946 roku, rozwiedli się w 1951 roku.
W 1951 roku podczas wyprawy na Islandię ożenił się ze swoją asystentką Philippą Talbot-Ponsonby, w 1952 roku przyszła na świat ich córka Dafila (imię to jest alternatywną nazwą gatunkową rożeńca zwyczajnego ptaka z rodziny kaczkowatych). Dafila Scott jest malarką, podobnie jak ojciec maluje ptaki. W 1954 roku urodził się ich syn Falcon.
Zmarł 29 sierpnia 1989 roku w Bristolu, przyczyną śmierci był atak serca.
Wyróżnienia, nagrody i upamiętnienie alt=Na zdjęciu widoczny pomnik z brązu. Na brzegu, na kamieniu Sir Peter Scott z lornetką w ręku, w kaloszach. W wodzie przy brzegu figura ptaka z rozłożonymi skrzydłami wykonana z brązu. |mały|Pomnik Sir Petera Scotta w rezerwacie London Wetland Centre. W czasie II wojny światowej dwukrotnie został wymieniony w sprawozdaniu, za udział w ratowaniu rozbitków z płonącego okrętu w 1941 roku i za odwagę w czasie rajdu na Dieppe w 1942 roku. 1 czerwca 1943 roku został odznaczony Krzyżem Wybitnej Służby.