Federico Finchelstein, naukowiec zajmujący się faszyzmem i populizmem, uznał Bolsonaro za polityka najbliższego Augusto Pinochetowi spośród liderów młodych południowoamerykańskich demokracji. Ze względu na swój otwarcie wyrażany podziw dla rządzącego w latach 2017–2021 prezydenta Stanów Zjednoczonych Donalda Trumpa, jest nazywany „brazylijskim odpowiednikiem Trumpa”, „brazylijskim Trumpem”, „Donaldem Trumpem z Ameryki Południowej”, „Donaldem Trumpem z Brazylii” lub „tropikalnym Trumpem”. Kilkukrotnie kierowano przeciwko niemu skargi do Międzynarodowego Trybunału Karnego w Hadze, między innymi zarzucając mu ludobójstwo rdzennej ludności Amazonii i zbrodnie przeciwko ludzkości.
Życie prywatne Trzykrotnie żonaty, ma pięcioro dzieci. Z małżeństwa z Rogérią Nantes Nunes (1993–2001) ma synów , i (deputowanego do Izby Deputowanych). Następnie żonaty z Aną Cristiną Vale, z którą miał syna, a od 2013 r. z , z którą ma córkę. Bolsonaro ma silne wsparcie w środowiskach protestanckich. Kiedyś był katolikiem, a obecnie jest baptystą. W 13 kwietnia 2025 przeszedł skomplikowaną operację jamy brzusznej, szóstą od kiedy został dźgnięty nożem podczas wiecu w 2018 roku.