Szemaja macedońska jest rybą bentopelagiczną. Osiąga maksymalnie 30 cm długości. Ciało ma srebrzyste, z wyjątkiem brązowego grzbietu, płetwy przeźroczyste. Linia boczna pełna, z 56–66 łuskami na ciele i 4 na podstawie płetwy ogonowej. Podstawa płetwy grzbietowej oddzielona od linii bocznej 9 rzędami łusek, podstawa płetwy brzusznej 3 rzędami. Płetwa grzbietowa z 8½ promieniami miękkimi, piersiowa z 16–17, brzuszna z 9–10. Płetwa ogonowa rozpostarta na 14–16½ promieniach. Ma 18 łusek wokół najwęższego miejsca trzonu ogonowego. Ma 25–31 wyrostków filtracyjnych.
Najbliższym geograficznie przedstawicielem rodzaju Alburnus dla Alburnus volviticus jest Alburnus vistonicus, gatunek również endemiczny i zagrożony wyginięciem, podawany tylko z jezior Wistonida, Ismarida i systemu rzecznego Filiouris. Różnią się jednak liczbą wyrostków filtracyjnych, która u Alburnus volviticus jest większa, i ułożeniem płetwy odbytowej w stosunku do podstawy płetwy grzbietowej.