Christophe Baudouin (ur. 19 maja 1961 w Nicei) – francuski okulista, profesor Uniwersytetu w Wersalu oraz szef kliniki okulistycznej w paryskim Narodowym Szpitalu Okulistycznym Quinze-Vingts.
Życiorys Studia medyczne ukończył w 1988 w rodzinnej Nicei na Université de Nice – Sophia Antipolis. Doktoryzował się w 1992 w Paryżu. W 1995 został szefem katedry i kliniki okulistyki w Ambroise Paré Hospital (AP-HP) Uniwersytetu w Wersalu (Université de Versailles-Saint-Quentin-en-Yvelines). W 2000 roku został także szefem kliniki okulistycznej w paryskim Narodowym Szpitalu Okulistycznym Quinze-Vingts (fr. Le centre hospitalier national d’ophtalmologie des Quinze-Vingts, ang. Quinze-Vingts National Ophthalmology Hospital). Od 1997 jest koordynatorem grupy badawczej zajmującej się immunologią i toksykologią powierzchni oka. Od 2004 jest dyrektorem zespołu badawczego w Vision Institute działającego w ramach paryskiego Université Pierre et Marie Curie oraz francuskiego Narodowego Instytutu Zdrowia i Badań Medycznych (INSERM).