Gdy stężenie metanu opadło do około 4 procent akcja została wznowiona, jednak 6 maja o godzinie 16:30 wystąpił wstrząs wtórny, który uwolnił duże ilości metanu, w wyniku czego, pomimo ciągłego pompowania powietrza, 7 maja stężenie metanu wciąż wynosiło jeszcze 8 procent – podczas gdy zastępy ratowników można wpuścić w rejon zagrożenia gdy jego zawartość wynosi poniżej 5 procent (przyjmowana dla metanu wartość dolnej granicy wybuchowości 4,91 procent objętości ulega obniżeniu wraz ze wzrostem temperatury i ciśnienia, natomiast wzrasta wraz ze spadkiem intensywności impulsu inicjującego, jest zależna również od miejsca, w którym mogłoby dojść zapalenia). Powołano zespół ds. zagrożeń naturalnych, złożony z ekspertów AGH, PŚ oraz GIG. Po wznowieniu prac za pomocą sprzętu hydraulicznego duże utrudnienia związane były z wypiętrzeniem spągu. 8 maja wykryto zakłócony sygnał radiowy lampy górniczej. W wyrobisku, jako kolejne utrudnienie, pojawiła się woda (podjęcie próby jej wypompowania oznaczało konieczność przetransportowania pomp na sprężone powietrze na miejsce rozlewiska), wykryto również sygnał drugiej lampy górniczej.