Kościół San Francesco – rzymskokatolicki kościół w Pawii pod wezwaniem św. Franciszka z Asyżu. Jest kościołem parafialnym parafii Francesco d'Assisi. Administracyjnie należy do diecezji Pawii.
Historia Franciszkanie przybyli do Pawii, podobnie jak do Mediolanu, pod koniec lat 20. XIII wieku. Początkowo osiedlili się poza murami miejskimi, a pod koniec następnej dekady rozpoczęli budowę kościoła pod wezwaniem św. Franciszka z Asyżu. Dokładna data jego fundacji nie jest jednak znana. Darowizny na jego budowę odnotowane zostały w latach 1267, 1277 i 1286. Gdy w 1298 roku franciszkanie ostatecznie opuścili swoją podmiejską osadę, oddając ją karmelitom, ich nowy kościół był już najprawdopodobniej ukończony. Długi okres budowy kościoła wyjaśnia różnicę stylową widoczną pomiędzy częścią prezbiterialną, bogatą w romańskie rozwiązania, inspirowane stylem cysterskim, a wyraźnie gotycką fasadą.
W XVIII wieku świątynię przebudowano. Po 1732 roku przy ścianie szczytowej północnego transeptu zbudowano kaplicę Niepokalanego Poczęcia, zaprojektowaną przez Giovanniego Ruggeriego;