325px|thumb|Par ljudskih hromosoma 10 u kariogramu muškarca right|350px 320px|right Hromosome 10 je jedan od 23 para hromosoma kod ljudi. Čovjek normalno ima njegove dvije kopije . Hromosom 10 spans ima oko 133 miliona baznih parova (gradivnog materijala DNK) i uključuje između 4 i 4,5 % ukupne DNK u ćelijama.
Geni Broj gena Slijede neke od procjena broja gena za ljudski hromosom 10. Budući da istraživači koriste različite pristupe označavanju genoma, njihova predviđanja broja gena na svakom hromosomu variraju (za tehničke detalje pogledajte predviđanje gena). Među različitim projektima, zajednički Projekt konsenzusnog kodiranja (CCDS) zauzima izuzetno konzervativnu strategiju. Dakle, predviđanje broja gena prema CCDS-u predstavlja donju granicu ukupnog broja gena koji kodiraju ljudske proteine.
Baza podataka Protein-kodirajući geni Nkoirajući geni RNK Pseudogeni Izvor Datum objave CCDS 706 — — 2016-09-08 HGNC 708 244 614 2017-05-12 Ensembl 728 881 568 2017-03-29 UniProt 750 — — 2018-02-28 NCBI 754 842 654 2017-05-19
Lista gena Slijedi djelimična lista gena na ljudskom hromosomu 10. Potpunu listu potražite u linku u informacijskom okviru s desne strane. AFAP1L2: Kodira aktinski filament vezan za protein 1 koji liči na 2 ALL1: Kodira protein leukemije, osjetljivosti akutne limfocitne 1 ALOX5: Kodira arahidonat 5-lipoksigenazu (procesuira esencijalne masne kiseline u leukotrine, koji suvažni agensi u upalnom odgovoru; također olakšava razvoj i održavanje matičnih ćelija karcinoma, ćelija koje se sporo dijele i za koje se smatra da uzrokuju razne karcinome, uključujući leukemiju). ARHGAP21: Kodira rho GTPazno aktivirajući protein 21 ARID5B: Kodira protein AT-bogatog interaktivnog domena koji sadrži protein 5B ARMH3: Armadillo-liki heliksni domen koji sadrži proteine grupe 3 AS3MT: Kodira enzim arsenit-metiltransferazu AVPI1: Kodira arginin vazopresin-pridruženi protein 1 C10orf67: Kodira otvoreni okvir čitanja 67 hromosoma 10 C10orf99: Kodira protein otvorenog okvira čitanja 99 hromosoma 10 CAMK1D: Kodira kalcij/kalmodulin-ovisni protein kinaze ID CCAR1: Kodira ciklus ćelijska diobe i regulatora 1 poptoze CCDC3: Kodira proteina 3 sa domenom upredene zavojnice CCDC186: Kodira protein CCDC186 CCNY: Kodira ciklin-Y CDC123: Kodira protein cikluds ćelijske diobe, homolog 123 CDH23: Kodira kaderin-oliki protein 23 CDNF: Kodira moždani dopaminski neurotrofni faktor COMMD3-BMI1: Kodira čitanje COMMD3-BMI1 CUTC: Kodira homeostazu bakra, proteinski homolog cutC CXCL12: Kodira hemokinski (C-X-C motiv) ligand 12, SDF-1, scyb12 DDX50: Kodira helikazu 50DExD-boksa DEPP: Kodira decidualni protein induciran progesteronom DHX32: Kodira helikazu 32 DEAH-boksa DNAJC12: Kodira DnaJ (Hsp40) homolog, porporodice član 12 DNAJC9: Kodira homolog DnaJ (Hsp40), potporodice c, član 9 DPYSL4: Kodira dihidropirimidinaza-srodni protein 4 EBLN1: Kodira protein endogenog bornavirus-olikog nukleoproteina 1 ECD: Kodira brzekscidnog regulatora ćelijskog ciklusa EGR2: Kodira rani odgovor na rast 2 (Krox-20 homolog, Drosophila) EIF5AP1: Kodira eukariotsku translaciju inicijacijskog faktora 5A-likog 1 EPC1: Kodira poboljšavač polikombnog homologa 1 ERCC6: Kodira nedostatak popravljanja ekscizijskog popravka kod glodara, komplementarna grupa 6 FAM107B: Kodira proteine sa sličnošću sekvence 107, član B FAM13C: Kodira proteine sa sličnošću sekvence 13, član C FAM170B: Kodira proteine porodice sa sličnošću sekvence 170, član B FAM188A: Kodira proteine porodice sa sličnošću sekvence 88, član A FAM213A: Kodira proteine sa sličnošću sekvence porodice 213, član A FAM25BP: Kodira protein FAM25 FAS-AS1: Kodira dugolančane nekodirajuće RNK FGFR2: Kodira receptor 2 faktora rasta fibroblasta (bakterijski-eksprimirana kinaza, receptor keratinocitnog faktora rasta, kraniofacijalna disostoza 1, Crouzonov sindrom, Pfeifferov sindrom, Jackson–Weissov sindrom) FRA10AC1: Kodira fragilno mjesto, tip folne kiseline FRAT1: Kodira regulator WNT-signalizirajućeg puta FRAT2: Kodira regulator WNT-signalizirajućeg puta FRMPD2: Kodira protein FERM i PDZ koji sadrži domen 2 GATA3: Kodira transkripcijski faktor GATA3, koji je kritičan za embbrounski razvoj paratireoidne žlijezde, nervne komponene čula sluha i bubrega. Haploinsuficijencija gena podložna je rijetkom poremećaju, zvanom sindrom displazije hipoparatirodizma, gluhoće i bubrega GHITM: Kodira hormonom rasta-inducibilni transmembranski protein GPRIN2: Kodira G protein-regulirani inducer izrastanja neurita 2 GTPBP4: Kodira jedarcetov GTP-vezujući protein 4 HELLS: Kodira limfoid-specifičnu helikazu HKDC1: Kodira heksokinazni domen koji sadrži proteine 1 KIN: Kodira DNK/RNK-vežuči protein KIN17 MTG1: Kodira mitohondrijsku GTPazu 1 NPM3: Kodira nukleoplazmin-3 NRBF2: Kodira jedarni receptor-vežući faktor 2 NSMCE4A: Kodira ne-SMC element 4, homolog A OTUD1: Kodira protein OTU-deubikvitinaza 1 PAPSS2: Kodira enzime bifunkcijske 3'-fosfoadenozin 5'-fosfosulfat sintaze 2 PCBD1: Kodira 6-piruvoil-tetrahidropterin sintaza/dimerizacijsi kofaktor hepatocita, jedarni faktor 1 alfa (TCF1) PCDH15: Kodira protokadherin 15 PI4K2A: Kodira fosfatidilinozitol 4-kinazu 2-alfa PIP4K2A: Kodira fosfatidilinozitol 5 fosfat 4-kinazni tip-2 alfa PITRM1: Kodira pitriluzin-metalopeptidazu 1 PLEKHS1: Kodira protein plekstrin homologijskog domena, koji sadrži S1 PLXDC2: Kodira pleksin domen-sadržeči protein 2 PROSER2: Kodira prolin- i serin-bogti 2 ili c10orf47 PTEN: Kodira fosfatazu i tenzinski homolog (mutiran u multiplo uznapredovalim kancerima 1) RET: Kodira ret protoonkogen (multipla endokrina neoplazija i karcinoma srži štitnjače 1, Hirschsprungova bolest) RPP30: Kodira ribonukleazni protein P, podjedinica p30 RRP12: Kodira procesuiranje rRNK, homolog 12 RSU1: Kodira ras supresorski protein 1 SGPL1: Kodira sfingozin-1-fosfanu lijazu 1 SMNDC1: Kodira preživlavanje motornog neuronskog domena, koji sadrži proteine 1 SPG9: Kodira protein spazamske paraplegije 9 (autosomno dominantne) SRGN: Kodira serglicin STAMBPL1: Kodira STAM-vežući proteinoliki 1 STOX1: Kodira protein Storkheadovog boksa 1 SUPV3L1: Kodira Suv3-oliku RNK-helikazu TACC2: Kodira protein transformirafuće kisele savijene zavojnice koja sadrži protein 2 TBC1D12: Kodira proteine porodice TBC1-domena, član12 TCTN3: Kodira porodicu strukturnih proteina, član 3 TMEM10: Kodira opalin TMEM26: Kodira transmembranski protein 26 TMEM72: Kodira transmembranski protein 72 UCN3: Kodira urokortin-3 UROS: Kodira uroporfirinogen III sintazu (kongenitalna eritropoetska porfrjia) USMG5: Kodira nadregulaciju tokom rasta skeletnih mišića, protein faktora rasta 5 USP6NL: Kodira USP6 N-kraj-oliki protein UTF1: Kodira transkripcijski faktor 1 nediferenciranih embrionskih cćelija VIM-AS1: Kodira VIM-antisens RNK 1 WASHC2C: Kodira WASH-kompleks, podjedinica 2C WBP1L: Kodira WW-domen vežuči protein 1-liki ZNF37A: Kodira protein cinkovog prsta 37A ZNF438: Kodira protein cinkovog prsta 438 ZRANB1: Kodira protein cinkovog prsta ranbp2-tip, koji sadrži proteine grupe 1
Bolesti i poremećaji Sljedeće bolesti povezane su s genima na hromosomu 10: Apertov sindrom Barakatov sindrom Beare-Stevensonov sindrom kutis girata Charcot-Marie-Toothova bolest Cockayneov sindrom Cowdenov sindrom Crouzonov sindrom Genitopatelni sindrom Hermansky-Pudlakov sindrom Hirschprungova bolest Jackson–Weissov sindrom Kongenitalna eritropoetska porfirija Multiformni glioblastom Multipla endokrina neoplazija tip 2 Nedostatak tetrahidrobiopterina Nesindromna gluhoća Pfeifferov sindrom Porfirija Spondiloepimetafizna displazija pakistanski tip Thiel-Behnkeova distrofija rožnjače Usherov sindrom Wolmanov sindrom Young-Simpsonov sindrom
Citogenetičke pruge
+ G-pruge ljudskog hromosoma 10 u rezoluciji 850 bphs Hromosom Kraci: "p" – kratki ; "q" – dugi BandFor cytogenetic banding nomenclature, see article locus. ISCNstartThese values (ISCN start/stop) are based on the length of bands/ideograms from the ISCN book, An International System for Human Cytogenetic Nomenclature (2013). Arbitrary unit. ISCNstop Bazni parstart Bazni parstop Boja Gustoća 10 p 15.3 0 229 gneg 10 p 15.2 229 329 gpos 25 10 p 15.1 329 630 gneg 10 p 14 630 917 gpos 75 10 p 13 917 1175 gneg 10 p 12.33 1175 1361 gpos 75 10 p 12.32 1361 1432 gneg 10 p 12.31 1432 1604 gpos 75 10 p 12.2 1604 1662 gneg 10 p 12.1 1662 1891 gpos 50 10 p 11.23 1891 2063 gneg 10 p 11.22 2063 2235 gpos 25 10 p 11.21 2235 2406 gneg 10 p 11.1 2406 2621 acen 10 q 11.1 2621 2850 acen 10 q 11.21 2850 3051 gneg 10 q 11.22 3051 3252 gpos 25 10 q 11.23 3252 3409 gneg 10 q 21.1 3409 3753 gpos 100 10 q 21.2 3753 3839 gneg 10 q 21.3 3839 4097 gpos 100 10 q 22.1 4097 4469 gneg 10 q 22.2 4469 4655 gpos 50 10 q 22.3 4655 4970 gneg 10 q 23.1 4970 5200 gpos 100 10 q 23.2 5200 5331 gneg 10 q 23.31 5331 5558 gpos 75 10 q 23.32 5558 5672 gneg 10 q 23.33 5672 5887 gpos 50 10 q 24.1 5887 5973 gneg 10 q 24.2 5973 6131 gpos 50 10 q 24.31 6131 6202 gneg 10 q 24.32 6202 6317 gpos 25 10 q 24.33 6317 6374 gneg 10 q 25.1 6374 6646 gpos 100 10 q 25.2 6646 6761 gneg 10 q 25.3 6761 6890 gpos 75 10 q 26.11 6890 7090 gneg 10 q 26.12 7090 7219 gpos 50 10 q 26.13 7219 7506 gneg 10 q 26.2 7506 7721 gpos 50 10 q 26.3 7721 8050 gneg Oznake: gpos – Regija koja je pozitivno obojena G-pruganjem, uglavnom AT-bogata i siromašna genima; gneg – Regija koja je negativno obojena G-prugama, općenito CG-bogata i bogata genima; acen Centromere; var – Varijabilna regija; stalk – drška.
References
Također pogledajte Hromosom Hromosomska garnitura Citogenetika
Reference
Vanjski linkovi
Kategorija:Hromosomi Kategorija:Geni na hromosomu 10 Kategorija:Citogenetika