Ugroženost bosanskohercegovačkih biljaka zabilježena je još za vrijeme austrougarske uprave. Pokušaje zakonske i svake druge kategorizacije biljnog svijeta u ovoj državi, bezuspješno su pokretani u drugoj par posljednjih decenija 20 stoljeća. Činili su to pretežno profesionalci sa Prirodno-matematičkog fakulteta, Šumarskog fakulteteta UNSA i Zemaljskog muzeja Bosne i Hercegovine, kao i aktivisti brojnih nevladinih organizacija, među kojima i Pokreta nauku mladima SRBiH. Međutim, organizirana državna intervencija u tom pravcu, uslijedila je tek na pragu 20. stoljeća, kada je preuzeta međunarodna obaveza u okviru aktivnosti IUCN-a. Međutim, početni polet je zastao nakon kreiranja crvenih knjiga FBiH i RS, a prepušten je aktivistima lokalnih zajednica. thumb|500px|Kategorizacija bosanskohercegovačkih biljaka prema kriterijima IUCN-a Nakon značajnih priloga poznavanju bosanskohercegovačke flore i faune, koji su djelo autora iz perioda austrougarske uprave u Bosni i Hercegovini i dosta vrijednih, ali fragmentarnih radova na istu temu, Društvo ekologa Bosne i Hercegovine je povjerilo Čedomilu Šiliću da pripremi listu biljnih vrsta za Crvenu knjigu Bosne i Herecgovine.
Šilić, vjerovatno najupućeniji dosadfašnji poznatelj biljnog svijeta, kreirao je Spisak biljnih vrsta (Pteridophyta i Spermatophyta) za Crvenu knjigu Bosne i Hercegovine koji je objavljen 1996. godine u Glasniku Zemaljskog muzeja Bosne i Hercegovine (Prirodne nauke), n.s. 31 (1992-1995): 323-367 (1996). Lista prvenstveno počiva na na literaturnih podacima o flori i vegetaciji Bosne i Hercegovine, prikupljenih od kraja 19. stoljeća do danas. Uključeno je ukupno 678 taksona Pteridophyta i Spermatophyta.
Uprkos ovim podacima u Crvenoj knjigi ugroženih biljaka iz 1997. godine koju je objavio IUCN navodi se da je broj ugroženih vrsta u Bosni i Hercegovini 64, odnosno da postoji i 7 istrebljenih, 3 ranjive, 59 rijetkih te jedna vrsta bez definisanog statusa, u skladu sa tada važećim kategorijama (IUCN, 1997). Projekat izrade Crvene liste flore, faune i gljiva u Federaciji Bosne i Hercegovine je rezultirao potpuno novim podacima o stanju flore u F BiH. Iako je analiza bila zasnovana na prijedlogu Crvene liste ju je sastavio Šilić, nakon intenzivne analize postojeće literature i terenskih istraživanja, obavljena je rekategorizacija statusa najvećeg broja taksona.
Ukupno je uklučeno 199 primarnih izvora iz perioda 1890-2012. Pritom je, zahvaljujući novom izvoru (Šoljan et al. 2012) status „vjerovatno izumrle vrste“ Astragalus fialae Degen promijenjen, tačnije potvrđeno je njeno postojanje na planini Visočici. Ova činjenica ponovo aktuelizira mogućnost postojanja vrste Astragalus fialae i na lokalitetu Velikog jezera na Treskavici (Herbarij Zemaljskog muzeja Bosne i Hercegovine), gdje su je pronašli Fiala (1893.) godine i Degen (1900.). Na ovom primjeru se može zaključiti da je kod izrade budućih crvenih knjiga Bosne i Hercegovine neophodno direktno provjeriti i sve dostupne izvore za svaku od popisani vrsta.
Nomenklatura biljnih taksona je data prema Međunarodnom kodeksu nomenklature algi, gljiva i biljaka (International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants, Melbourne Code) koja je usvojena na 18. Internacionalnom botaničkom kongresu održanom u Melburnu u julu 2011. godine.
Podaci o taksonima, pored naziva sadrže sinonime, narodni naziv, predloženu kategoriju, te popis lokaliteta i najznačajnije literaturne reference. U procjeni statusa taksona korištena je IUCN Red List categories verzija 3.1. Rezultati, koji su dobijeni na osnovu referentnih izvora, pokazuju da na području BiH u Crvenu listu flore treba uključiti 659 taksona. Najviše ih spada u kategoriju ranjivih (VU) – 26,25%. Za znatan broj taksona (24,43%) će biti neophodno pribaviti dodatne podatke prije definisanja statusa.
Distribucija biljnih taksona po kategorijama ugroženosti Kategorizacija posanskohercegovačkih biljaka prema kriterijima IUCN-a: Kategorije ugroženosti taksona Izumrle (Extinct –Ex) 2 (0,30%) Vjerovatno izumrla vrsta (Extinct – Ex?) 6 (0,89%) Ugrožena ili ranjiva vrsta (Vulnerable – V) 42 (6,20%) Rijetka ili potencijalno ugrožena vrsta (Rare – R) 287 (42,30%) Nedovoljno poznata vrsta (Insufficiently Known – K) 54 (7,97%) Nedovoljno istražene (DD): 161 (57,96%) Bez kategorije 2 (0,30%) Ukupno: 678 (100,00%). Federalno ministarstvo okoliša i turizma (2013): Crvena lista flore FBiH Pristupljeno 20 februara 2020.
Kategorija: Nedovoljno podataka (DD)
Aceras anthropophorum (L.) Aiton fiI. Achillea x albinea Bjelčić et K. Maly Agrostis vranicensis Pawl Alchemilla alpestris Schmidt Alchemilla vranicensis Pawlowsky Alectrolophus asperulus Murb. Alectrolophus bosniacus Behr. Alectrolophus burnatii (Chab.) Stern Alectrolophus dinaricus (Murb.) Sterneck Alectrolophus mediterraneus Stern. subsp. aruensis (Chab.) K. Maly Alectrolophus ovifugus (Chab.) Stern. Allium dalmaticum A. Kerner ap Janchen Allium phthioticum Boiss. Angelica illyrica K. Maly Arabis scopoliana Boiss. Arctous alpina (L.) Niedenzu Arenaria halacsyi Bald. Armeria alpina (DC.) Willd. Bellardia trixago (L.) All. Biarum tenuifolium (L.) Schott Bruckenthalia spiculifolia (Salisb.) Reichenb. Bupleurum ranunculoides L. Cachrys alpina M. B. (incl. C. laevigata Lam. (Ex.) Campanula thyrsoides L. Campanula unae Šoljan Cardamine glandulosa (W. et K) Schmalh. Cardamine pentaphyllos (L.) Cr.Carduus angusticeps Lindb.Carduus illyricus K MalyCarduus ramosissimus PancicCarex buxbaumii Wahlenb.Carex ferruginea Scop.Carex mucronata All.Carex nigra All.Carex paradoxa Willed.Centaurea aterrima HayekCentaurea crnagorica RohlenaCentaurea fritschii HayekCentaurea haynaldi Borbás ex Vuk. ssp. haynaldiiCentaurea incompta Vis.Centaurea rupestris L.Centaurea tuberosa Vis.Centranthus velenovskyi VandasCicuta virosa L.Cirsium dinaricum VandasClypeola jonthlaspi L.Colchicum kochii Parl.Corallorrhiza trifida Châtel.Coronilla elegans PančićCorylus x intermedia Lodd.Crataegus nigra Waldst. et Kit.Crataegus pentagyna Waldst.et Kit. ex Willd.Crepis aurea (L.) Cass. (incl. Crepis bosniaca K. MalyCrepis blavii (Aschers.) Stadlm.Crepis chondrilloides Jacq.Crepis kerneri Rechinger fil.Crepis x malyi Stadlm.Dactylis aschersonialla Gracbn.Danaa cornubiensis (L.) Burn.Danaa verticillata (W. et K.) JanchenDaphne oleoides Schreb.Daucus guttatus Sibth. et Sm.Draba longirostra Schott, Nyman et KotschyDryopteris cristata (L.) A.Gray (Ran Kram)Edraianthus x murbecki Wettst.ap. Murb.Empetrum hermaphroditum HagerupEpipogium aphyllum Sw.Erigeron atticus Vill.Eryngium palmatum Pane. et. Vis.Euphrasia minima Jacq. ex DC.Festuca illyrica Markgr.-Dann.Galanthus reginae-olgae Orph.Gentiana ciliata (L.) Borkh.Gentiana jasnae LakušićGentianella pevalekii Bjelčić et MayerGeum molle Vis. et PančićGoniolimon dalmaticum (C. Pres) Reiehenb. (incl. f. hercegovinicum Novak)Gymnadenia friwaldii Hampe ex Gris.Hacquetia epipactis (Scop.) DC.Haplophyllum albanicum (Bald.) Bornm.Haplophyllum boissieranum Vis. et. Panč.Herminium monorchis (L.) R. Br.Hieracium pallescentifrons Maly K et Zahn. Hieracium tajanum K. Maly et Zahn.Hydrocotyle vulgaris L. Hyoscyamus albus L. Hypericum degenii Bornm. Inula bifrons (Gou.) L. Iris pseudopallida Trinajstić Iris varbossania K. Maly Juncus thomasii Ten. subsp. palensis K. Maly Knautia visianii Szabó Knautia x trebeviciensis Szabo Laburnum anagyroides Medik Lathyrus friedrichsthalii (Griseb.) K. Maly Lathyrus palustris L. Leucanthemum rotundifolium (W. et K. ex Willd.) DC. Lilium albanicum Grisebach Lilium bulbiferum L. Lilium carniolicum Bernh. Ex Koch. Linaria microsepala A. Kern. Linaria pelisseriana (L.) Mill. Linaria rubioides Vis. et Panč. Liparis loeselii (L.) Rich Listera cordata (L.) R. Br. Matthiola tristis R. Br. var. italica Conti Melampyrum doerfleri Ronn. Melampyrum fimbriatum Vand. Melampyrum hoermannianum K. Maly Orlaya platycarpos Koch Orobanche salviae F. Schultz ex Koch in Rohling Oxytropis jacquinii Bunge Paederota lutea Scop. Pedicularis acaulis Scop. Pedicularis heterodonta Pancic Petasites dorfieri Hayek Phyteuma scheuchzeri All. Pinguicula hirtiflora Ten. Polemonium caeruleum L. Potentilla montenegrina Pant. Poterium spinosum L. Primula farinosa L. Prunus cocomilia Ten. Prunus fruticosa Pallas Pyrola chlorantha Swartz Pyrola rotundifolia L. Ranunculus hayekii Dörfl. Ranunculus hybridus Biria Ranunculus serbicus Vis. Salvia sonklarii Pant. Scabiosa hladnikiana Host Scabiosa portae A. Kern. ap. Hut. Scandix macrorhyncha C. A. Meyer Scrophularia scopolii Hoppe in Pers. Scrophularia vernalis L. Sedum serpentini Janch. Senecio carpaticus Herb. Senecio wagneri Degen Seseli bosnense K. Maly Seseli promonense Vis. Silene hayekiana Hand. - Mazz.et Janch. Silene monachorum Vis. et PančičSilene quadridentata auct., non (L.) Pers. subsp. phyllitica H. NeumayeSiler trilobum (L.) CrantzStachys menthifolia Vis.Sternbergia colchicflora Waldst. et Kit. var. dalmatica ReichenbTanacetum alpinum (L.) Schultz Bip.Tanacetum serotinum (L.) Schultz Bip.Thlaspi goesingense HalacsyThlaspi jankae A.Kern.Thlaspi kerneri HuterTilia travnicensis K MalyTypha laxmannii Lepechin Utricularia neglecta Lehro.Verbascum niveum Ten.Veronica fruticans Jacq.Veronica scardica Griseb.Viola grisebachiana Boiss.Zanichellia palustris L.
Kategorija: Ranjivi (VU)Achillea abrotanoides (Vis.) Vis.Achillea clavennae L.Achillea lingulata Waldst. et Kit.Achillea ptarmica L.Acorus calamus L.Adenophora liliifolia (L.) Ledeb.ex A.DC.Adiantum capillus-veneris L.Anemone baldensis L.Anemone narcissiflora L.Angelica brachyradia FreynAnthericum liliago L.Anthyllis aurea HostAnthyllis illyrica G. BeckArnica montana L.Artemisia eriantha Ten.Arum nigrum SchottAsphodelus microcarpus VivoAsplenium cuneifolium Viv.Asplenium lepidum C. PreslAsplenium septentrionale (L.) Hoffm.Aster alpinus L.Aster illyricus (Murb.) K. MalyAstrantia carniolica Wulf. in Jacq.Aubrieta croatica Schott, Nyman et KotschyBerberis croatica HorvatBotrichium simplex HitchcBupleurum karglii Vis.Campanula latifolia L.Cardamine polyphylla (W. et K) O. E. SchulzCardaminopsis croatica (Schott, Nyman et Kotschy) Jav.Carex acutiformis Ehrh.Carex davalliana Sm.Carex rupestris All.Castalia alba (L.) WoodCeltis tournefortii Lam.Centaurea alpina L.Centaurea bosniaca HayekCentaurea kotschyana Heuff. ex KochCentaurea murbeckii HayekCentaurea smolinensis HayekCephalanthera longifolia (L.) FritschCephalanthera rubra (L.) Rich.Cephalaria pastricensis Döftl. et HayekChamaecytisus tommasinii (Vis.) Rothm.Cicerbita pancicii (Vis.) Beauv.Circaea alpina L.Crepis alpestris (Jacq.) Tsch.Crepis pantocsekii (Vis.) LatzelCynoglossum velebiticum Borb. ex K. MalyCytisus bosniacus G. Beck Daphne blagayana FreyerDelphinium fissum Waldst. et Kit.Dianthus freynii VandasDianthus tergestinus (Rchb.) A. Kern.Digitalis lanata Ehrh.Doronicum hungaricum Reichenb.fil. Dryas octopetala L.Edraianthus dalmaticus (A.DC.) A.DC.Eleocharis carniolica KochElyna myosuroides (Vill.) FritschEriophorum gracile Koch ex RothEryngium alpinum L.Euphorbia fragifera Jan.Euphorbia glabriflora Vis.Euphorbia montenegrina (Bald.) K. Maly ex RohlenaFestuca dalmatica (Hack.) K. Richt.Festuca violacea Gaud. var. korabensis Jav. ex Mgf. - Dbg.Fritillaria gracilis (Ebel) Asch. et Gr.Fritillaria tenella M. B.Gentiana dinarica G. BeckGentiana kochiana Perro et Song.Gentiana nivalis L.Gentiana punctata L.Gentianella crispata (Vis.) J. Holub (aggr.)Grafia golaka (Hacq.) Reichenb.Helleborus hercegovinus MartinisHelleborus multifidus Vis.Hepatica nobilis Schreb.Himantoglossum calcaratum G. Beck Hippuris vulgaris L Hydrocharis morsus-ranae L. Ilex aquifolium L. Knautia travnicensis (Beck) Szabo Lathyrus binatus Pančić Lathyrus laevigatus (Waldst. et Kit.) Gren. Leontopodium alpinum Cass. Lepidotis inundata (L.) C.Borner Leucanthemum praecox (Horvatić) Horvatić Lilium cattaniae (Vis.) Vis. Limodorum abortivum (L.) Sw. Maianthemum bifolium (L) F. M. Schmidt Marsilea quadrifolia L. Matteucia struthiopteris (L.) Tod.