thumb|Predviđena tercijarna struktura ANKRD24 upotrebom I-TASSER-a|320x320px Ankirin ponavljajući domen-sadržavajući protein 24 je protein koji je kod ljudi kodiran genom ANKRD24. Ovaj gen je također znan i kao KIAA1981. Funkcija proteina kod ljudi još uvijek nije poznata. ANKRD24 je u porodici proteina koja sadrži domen ankirinskog ponavljanja.

Gen Lokus thumb|320x320px|Citogenetička lokacija gena ANKRD24 thumb|320x320px|Susjedstvo gena ANKRD24 Gen se nalazi na hromosomu 19 na poziciji p13.3 prednjeg lanca. Gen je dugačak 4041 parova baza i sadrži 29 egzona. U susjedstvu je gena SIRT6, koji kodira protein sirtuin-6 i gena EBI3,koji kodira protein Epstein-Barrovog gena3 virusne indukcije.

Ekspresija Obrazac ekspresije ANKRD24 je nekarakterističan. U uslovima rasta i proliferacije ćelija, nivo ekspresije se povećava. U tumorima klice, glioma i raka prostate, ekspresja je povišena u odnosu na druga stanja bolesti. Tokom razvoja, nivo ekspresije je povišen u fazi blastocista. U odraslih je povišen nivo ekspresije u placenti, želucu, bubrezima i oku u odnosu na druga tkiva. Međutim, rezultati eksperimentalnih profila ekspresije gena nisu konzistentni u odnosu na ekspresiju ANKRD24, što upućuje na redundanciju gena i njegovog proteinskog proizvoda.

iRNK Alternativna ekspresija Predviđeno je 13 varijanti prerade transkripata iRNK ANKRD24-a.

Protein Opća svojstva Protein ANKRD24 dugačak je 1146 aminokiselina, ima molekulsku težinu 124 kDa i izoelektričnu tačku od 4,98. Predviđa se da se sekundarna struktura sastoji od svih alfa-heliksa i da neće sadržavati ni jedan beta-list. Predviđa se da će tercijarna struktura proteina biti spiralna zavojnica.

Sastav ANKRD24 ima relativno visok sadržaj alanina (15,0%), glutaminske kiseline (13,5%) i leucina (11,0%) i relativno nizak sadržaj cisteina ( 1,5%), fenilalanina (0,7%), triptofana (0,2%) i tirozina (0,8%). Protein sadrži pozitivne klastere koji bi mogli biti signali jedarne lokalizacije. Protein nema značajnije nakupine negativnog naboja i nema značajne obrasce naboja uopće.

Aminokiselinska sekvenca

1020304050 MKTLRARFKKTELRLSPTDLGSCPPCGPCPIPKPAARGRRQSQDWGKSDE RLLQAVENNDAPRVAALIARKGLVPTKLDPEGKSAFHLAAMRGAASCLEV MIAHGSNVMSADGAGYNALHLAAKYGHPQCLKQLLQASCVVDVVDSSGWT ALHHAAAGGCLSCSEVLCSFKAHLNPQDRSGATPLIIAAQMCHTDLCRLL LQQGAAANDQDLQGRTALMLACEGASPETVEVLLQGGAQPGITDALGQDA AHYGALAGDKLILHLLQEAAQRPSPPSALTEDDSGEASSQNSMSSHGKQG APKKRKAPPPPASIPMPDDRDAYEEIVRLRQERGRLLQKIRGLEQHKERR QQESPEASSLHILERQVQELQQLLVERQEEKESLGREVESLQSRLSLLEN ERENTSYDVTTLQDEEGELPDLPGAEVLLSRQLSPSAQEHLASLQEQVAV LTRQNQELMEKVQILENFEKDETQMEVEALAEVIPLALYDSLRAEFDQLR RQHAEALQALRQQETREVPREEGAACGESEVAGATATKNGPTHMELNGSV APETKVNGAETIDEEAAGDETMEARTMEAEATGAEATGAEATGAKVTETK PTGAEVREMETTEEEANMETKPTGAQATDTETTGVEAMGVEATKTKAEEA EMQAYGVGAGQAEPPVTGTTNMEATGSRATGMESTGVSATGVENPGVEAT VPGISAGPILHPGAAEASEKLQVELETRIRGLEEALRQREREAAAELEAA LGKCEAAEAEAGRLRERVREAEGSGASGGGGGDTTQLRAALEQAREDLRD RDSRLRELEAASACLDEARASRLLAEEEARGLRAELAQREEARLEQSREL EVLREQLATARATGEQQRTAAAELGRARDAAEARVAELPAACEEARQGLA ELREASEALRQSVVPASEHRRLQEEALELRGRAASLEQEVVATGKEAARL RAELERERVCSVALSEHERIVGTLQANVAQLEGQLEELGRRHEKTSAEVF QVQREALFMKSERHAAEAQLATAEQQLRGLRTEAERARQAQSRAQEALDK AKEKDKKITELSKEVFNLKEALKEQPAALATPEVEALRDQVKDLQQQLQE AARDHSSVVALYRSHLLYAIQGQMDEDVQRILSQILQMQRLQAQGR Simboli

C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin

Subćelijska lokalizacija Predviđa se da se protein ANKRD24 lokalizira u jedrima ćelija.

Domeni ANKRD24 je u porodici proteina koja sadrži ankirin-ponavljajućere domene. Ponavljanja ankirina poznata su po tome što ulaze u interakcije protein-protein. Protein takođe sadrži dvije regije upredene zavojnice.

Post-translacijska modifikacija Predviđa se da se ANKRD24 podvrgava C-manodilaciji.

Interaktivni proteini Predviđa se da ANKRD24 stupa u interakciju s diskovima velikog homologa 4 (DLG4), faktora produženja eukariotske translacije 1-alfa 1 (EEF1A1, unc-119 homologa A (UNC119), regulatornim faktorom vremena replikacije 1 (RIF1), proteinom kinaza C i supstratom kazein-kinaza u neuronima 1 (PACSIN1), podjedinicom jedarnog faktors NF-kappa-B p105 (NFKB1), kolesti-5-en-3β, 7α-diol 3β-dehidrogenaza (HSD3B7om, homologom smrtonosnih divovskih larvi 2 (L2GL2) i glukokortikoidom induciranim 1 (GLC) CI1. Karakterizacija ovih interakcija još nije obavljena.

Homologija thumb|280px| Neukorijenjeno filogenetsko stablo ANKRD24 ANKRD24 nema ljudskog paraloga. Ortolognii proteini nalaze se u drugim organizmima. Sljedeća tabela predstavlja neke od ortologa pronađenih korištenjem pretraživanja u BLASTu. BLAT-u. Međutim, ovaj popis nije konačan za ortologe ANKRD24 i namijenjen je samo prikazivanju široke raznolikosti vrsta za koje se mogu naći ortolozi ANKRD24.

Rod vrsteUobičajeno imeDatiranjedivergencije (milioni godina)Pristup nukleotidimaPristup proteinimaDužina sekvence (bp)Dužina sekvence (aa) E-vrijednost Identitet sekvence (%) Sličnost sekvence (%)1 Homo sapiensLjudi0NM_133475.1NP_597732.1404111461001002Nomascus leucogenys Sjeverni bjeloobrazni gibon 19,9XM_012503370.1XP_012358824.136751165095963Otolemur garnettiiMalouhi galago75,9XM_012804592.1XP_012660046.141811035083874Trichechus manatus latirostrisFloridski manati105XM_004378459.1XP_004378516.1|33541117081865Eptesicus fuscusVeliki smeđi šišmiš97,5XM_008150610.1XP_008148832.133691122080846Ailuropoda melanoleucaGigantska panda97,5XM_002928471.2XP_002928517.137291116080847Loxodonta africanaAfrički savanski slon 105XM_003421925.2XP_003421973.140491345079858Octodon degusDegu90,9XM_004632746.1XP_004632803.133811126079849Chrysochloris asiaticaBjelokapa krtica105XM_006869037.1XP_006869099.1374712480788510Orcinus orcaKit-ubica97,5XM_004277648.2XP_004277696.1348210790778211Chelonia mydas Zelena morska kornjača320,5XM_007072230.1XP_007072292305110169.00E-178637712Ficedula albicollis Ogrličasta muholovka320,5XM_005060250.1XP_00506030718856212.00E-171607413Gekko japonicusJapanski gekon320,5XM_015410656.1XP_015266142305710193.00E-175587514Python bivittatusBurmanski piton320,5XM_007434390XP_007434452319210631.00E-167587515Falco cherrugStepski soko320,5XM_014277718.1XP_01413319314314760577116Stegastes partitus Dvobojna samodopadnica429,6XM_008295305.1XP_008293527.1362910952.00E-90415517Trichomonas vaginalis G3Trichomonas vaginalis2040XM_001329224.1XP_0013292597742572.00E-24345418Ciona intestinalisVazasta tunikata733XM_009863371.1XP_00986167331569569.00E-24324819Talaromyces stipitatusGljiva1302,5XM_002486774.1XP_002486819.1321610713.00E-18325120Cryptococcus neoformansKvasac1302,5 XM_012197089.1XP_012052479.19432363.00E-163251

Reference

Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Geni na hromosomu 19