Član 3E/3F domenske porodice TBC1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom TBC1D3F.
Ovaj gen kodira protein koji je sličan porodici TBC1 domena, član 3. Protein sadrži TBC (Tre-2, Bub2p i Cdc16p) domen, koji se nalazi u proteinima uključenim u signalizaciju RAB GTPaza i promet vezikula. Postoje dvije kopije ovog gena, unutar skupa hemokinskih gena na hromosomu 17q; ovaj zapis predstavlja kopiju više centromera.
Analizom genomske sekvence, Hodzic et al. (2006) identificirali su osam paraloga gena TBC1D3 na hromosomu 17, uključujući TBC1D3F, koji su nazvali paralog E. Svi paralozi TBC1D3 kodiraju izvedeni protein s 549 aminokiselina, ali promjene pogreške na šest ostataka među paralozima rezultiraju u pet različitih izoformi TBC1D3. Geni TBC1D3F i TBC1D3E kodiraju identične proteine. Čini se da se paralozi TBC1D3 u ljudskim tkivima različito eksrimiraju.Hodzic, D., Kong, C., Wainszelbaum, M. J., Charron, A. J., Su, X., Stahl, P. D. TBC1D3, a hominoid oncoprotein, is encoded by a cluster of paralogues located on chromosome 17q12. Genomics 88: 731-736, 2006. PubMed: 16863688
Dužina polipeptidnog lanca je 549 aminokiselina, a molekulska težina 62.185..
Aminokiselinska sekvenca Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
1020304050 MDVVEVAGSWWAQEREDIIMKYEKGHRAGLPEDKGPKPFRSYNNNVDHLG IVHETELPPLTAREAKQIRREISRKSKWVDMLGDWEKYKSSRKLIDRAYK GMPMNIRGPMWSVLLNIEEMKLKNPGRYQIMKEKGKRSSEHIQRIDRDVS GTLRKHIFFRDRYGTKQRELLHILLAYEEYNPEVGYCRDLSHIAALFLLY LPEEDAFWALVQLLASERHSLQGFHSPNGGTVQGLQDQQEHVVATSQPKT MGHQDKKDLCGQCSPLGCLIRILIDGISLGLTLRLWDVYLVEGEQALMPI TRIAFKVQQKRLTKTSRCGPWARFCNRFVDTWARDEDTVLKHLRASMKKL TRKKGDVPPPAKPEQGSSASRPVPASRGGKTLCKGDRQAPPGPPARFPRP IWSASPPRAPRSSTPCPGGAVREDTYPVGTQGVPSPALAQGGPQGSWRFL QWNSMPRLPTDLDVEGPWFRHYDFRQSCWVRAISQEDQLAPCWQAEHPAE RVRSAFAAPSTDSDQGTPFRARDEQQCAPTSGPCLCGLHLESSQFPPGF
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Geni na hromosomu 17 Kategorija:Proteomika