TOM1-oliki protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran gen om TOM1L1.
Dužina polipeptidnog lanca je 476 aminokiselina, a molekulska težina 52.989..
Aminokiselinska sekvenca Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin <b> L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
1020304050 MAFGKSHRDPYATSVGHLIEKATFAGVQTEDWGQFMHICDIINTTQDGPK DAVKALKKRISKNYNHKEIQLTLSLIDMCVQNCGPSFQSLIVKKEFVKEN LVKLLNPRYNLPLDIQNRILNFIKTWSQGFPGGVDVSEVKEVYLDLVKKG VQFPPSEAEAETARQETAQISSNPPTSVPTAPALSSVIAPKNSTVTLVPE QIGKLHSELDMVKMNVRVMSAILMENTPGSENHEDIELLQKLYKTGREMQ ERIMDLLVVVENEDVTVELIQVNEDLNNAILGYERFTRNQQRILEQNKNQ KEATNTTSEPSAPSQDLLDLSPSPRMPRATLGELNTMNNQLSGLNFSLPS SDVTNNLKPSLHPQMNLLALENTEIPPFAQRTSQNLTSSHAYDNFLEHSN SVFLQPVSLQTIAAAPSNQSLPPLPSNHPAMTKSDLQPPNYYEVMEFDPL APAVTTEAIYEEIDAHQHKGAQNDGD
TOM1L1 pripada porodici proteina povezanih s TOM1, koji su uključeni u endocitozu. Ovi proteini imaju N-terminalni Vps27 / HGS /STAM (VHS) domen, nakon čega slijedi GGA/ TOM1 (GAT) domen.
Kloniranje i ekspresija N-terminalni domen TOM1 dijeli sličnost sekvenci s N-terminalnim domenima ljudskog HGS-a i STAM-a i kvščevog VPS27, a svi su proteini povezani s prometom vezikula na endosomu. Pretražujući baze podataka sa sekvencama, koristeći TOM1 kao upit, Seroussi et al. (1999) identificirali su TOM1L1 kao drugi protein sa N-terminalnim domenom sličnom onom kod TOM1. Autori su složili sekvence grupe ljudskih TOM1L1 EST u susjednu cDNK, koja kodira izvedeni protein od 476 aminokiselina. TOM1L1 dijeli 37% identiteta sekvence s TOM1; njegov domen C-terminala nije sličan domenu TOM1.Seroussi, E., Kedra, D., Kost-Alimova, M., Sandberg-Nordqvist, A.-C., Fransson, I., Jacobs, J. F. M., Fu, Y., Pan, H.-Q., Roe, B. A., Imreh, S., Dumanski, J. P. TOM1 genes map to human chromosome 22q13.1 and mouse chromosome 8C1 and encode proteins similar to the endosomal proteins HGS and STAM. Genomics 57: 380-388, 1999. [PubMed]: 10329004 PCR-om biblioteke cDNK ljudske jetre, Katoh et al. (2006) klonirani ljudski TOM1L2. Izvedeni protein ima N-terminalni VHS domen, centraln GAT domen i C-terminalni domen sa sekvencom kutije klatrina.
Funkcija gena Koristeći 2-hibridne testove kvasaca, Puertollano (2005) otkrio je da je ljudski TOM1L1 stupio u interakciju sa komponentama multivezikulskih mehanizma za sortiranje tijela, uključujući TSG101 (601387) i HRS (HGS), endosomski regulator razgradnje proteina.Puertollano, R. Interactions of TOM1L1 with the multivesicular body sorting machinery. J. Biol. Chem. 280: 9258-9264, 2005. [PubMed]: 15611048 Epitop-označeni TOM1L1 eksprimiran je u citosolu transficiranih HeLa ćelija, ali koekspresija HRS-a preraspodijelila je TOM1L1 na endosome. Ekspresija konstitutivno aktivnog oblika FYN promovirala je fosforilaciju tirozina TOM1L1, inducirala povećanje endosoma i promovirala regrutaciju TOM1L1 u povećane endosome. Koristeći testove in vitro, Franco et al. (2006) otkrili su da je miš Tom1l1 stupio u interakciju i bio supstrat za kinaze porodice SRC (SFK) ljudskog SRC-a i goveđeg Fyn.Franco, M., Furstoss, O., Simon, V., Benistant, C., Hong, W. J., Roche, S. The adaptor protein Tom1L1 is a negative regulator of Src mitogenic signaling induced by growth factors. Molec. Cell. Biol. 26: 1932-1947, 2006. PubMed: 16479011 Fosforilirani Tom1l1 stabilizirao je Fyn u otvorenoj i aktivnoj konformaciji i povećao aktivnost fosforilacija rekombinantnih ljudskih SRC i FYN. Tom1l1 inhibirao je mitogeni efekt SFK signalizacije, induciran PDGF-om u fibroblastima miša, ometajući interakciju SFK-PDGF receptora, uzrokujući blokadu G1-fazu ćelijskog ciklusa. Koekspresija ljudskih SFK suprotstavila se G1 bloku induciranom Tom1l1. Nokdaun Tom1l1, neutralizacijom antitijela ili malom interferirajućom RNK, povećao je broj ćelija koje su ušle u S-fazu nakon PDGF stimulacije. Prekomjerna ekspresija srodnih molekula Tom1l2 i Tom1 također je inhibirala PDGF-induciranu sintezu DNK, ali sa znatno nižom snagom. S obzirom na predviđenu ulogu proteina povezanih s TOM1 u endocitozi, Franco et al. (2006) pretpostavili su da TOM1L1 može sudjelovati u reciklaži PDGF receptora. Koristeći imunoprecipitaciju i Western blot analizu, Katoh et al. (2006) pokazali su da su C-terminalni domeni TOM1L1 i TOM1L2 u interakciji sa teškim lancem klatrina (CLTC). GAT domene TOM1L1 i TOM1L2 u interakciji su s endosomnim proteinom TOLLIP. Kada su se koeksprimirali, TOM1 i TOM1L1 regrutovani su u TOLLIP pozitivne endosome. Katoh i dr. (2006) zaključili su da, zajedno s TOLLIP-om, proteini porodice TOM1 regrutuju klatrin na endosome i moduliraju endosomsku funkciju.Katoh, Y., Imakagura, H., Futatsumori, M., Nakayama, K. Recruitment of clathrin onto endosomes by the Tom1-Tollip complex. Biochem. Biophys. Res. Commun. 341: 143-149, 2006. [PubMed]: 16412388
Gross (2012) mapirao je gen TOM1L1 u hromosomsku sekvencu 17q22, na osnovu poravnanja sekvence TOM1L1 (GenBank AJ010071) sa genomskom sekvencom (GRCh37).Franco, M., Furstoss, O., Simon, V., Benistant, C., Hong, W. J., Roche, S. The adaptor protein Tom1L1 is a negative regulator of Src mitogenic signaling induced by growth factors. Molec. Cell. Biol. 26: 1932-1947, 2006. [PubMed]: 16479011
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 17 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika