Protein 157 pridružen cilijama i flagelama (CFAP157), znan i kao otvoreni okvir čitanja 117 hromosoma 9 (c9orf117) jest protein loji je kod ljudi kodiran genomt CFAP157 .

Prema UniProt-u, gen CFAP157 je "specifično potreban tokom spermatogeneze za morfogenezu flagela i pokretljivost sperme, a može biti potreban i za suzbijanje stvaranja prekobrojnih aksonema i osiguravanje ispravne ultrastrukture".

Gen Lokacija CFAP157 se kod ljudi nalazi na hromosomu 9, sekvenca 9q34.11 od baznog para 127.706.989 do baZNOG PARA 127.716.002. 393x393px|center|thumb|Lokacija CFAP157 na hromosomu 9

Obilježja Veličina gena je 9.013 baza, a orijentacija je plus lanac. Gen sadrži 9 egzona.

iRNK Najčešća varijanta iRNK CFAP157 sadrži 1.722 parova baza.

Ekspresija CFAP157 se eksprimira u mnogim tkivima ljudskog tijela, kao što su grlić maternice, pluća, sjemenici i materica. Žeme koje imaju tumor maternice vjerovatno imaju ekspresiju u CFAP157. Ovaj gen je ehsprimiran je i kod odraslih i kod fetusa.

Protein Kod čovjeka, u CFAP157 ima 520 aminokiselina. Protein je izuzetno bogat glutaminom, a siromašan glicinom. Prilično je neutralan sa izoelektrična tačka pri pH 7,4. Prosječna molekulska masa proteina procijenjena je na 60,531.748 Da, a koeficijent apsorpcije 25.440 M−1 cm−1.

CFAP157 se prvenstveno sastoji od α-heliksa, a ne postoji transmembranska spirala. Za kreiranje predviđene strukture CFAP157.Program za izradu strukture proteina koristi se program pod nazivom Phyre

frame|288x288px|Predviđena struktura CFAP157 prema Phyre-u|center

Homologija

Ne postoji poznati paralog za CFAP157 kod ljudi. CFAP157 ima brojne ortologe. Sljedeća tabela sadrži neke od ortologa, uključujući čovjeka, običnog čimpanzu, rezus-makaka, govedo, psa, miša, pacova, tropsku kandžastu žabu i zebricu.

Vrsta Uobičajeno ime Pristupni brojIdentitet sekvence Sličnost sekvence Homo sapiens Čovjek NP_001012520 100% 100% Pan troglodytes Obični čimpanza XP_001143084 98,5% 99,0% Macaca mulatta Reus makak XP_001095281 95,2% 96,4% Bos taurus Govedo XP_005213477 70,5% 84,0% Canis lupus familiaris Pas XP_005625392 71,5% 80,9% Mus musculus Miš NP_079895 64,6% 79,0% Rattus norvegicus Pacov NP_001094339 64,2% 78,4% Xenopus tropicalis Tropska kandžasta žaba NP_001072774 41,5% 60,5% Danio rerio Zebrica NP_001103638 34,0% 54,9%

Interaktivni proteini P14335 (Kunjin virus soj MRM61C) je virus koji stupa u interakciju s CFAP157 putem dvohibridnog pregleda. Kunjin virus nije tako ozbiljan kao drugi virusi, ali ovo je zapaženo otkriće jer je moguće iskoristiti interakciju za razvoj novih tipova lijekova. Istraživači sa Univerziteta u Queenslandu otkrili su novu medicinsku upotrebu virusa kunjin 2005. godine, a mogući tretmani uključuju vakcine protiv HIV-a/kancera.

Reference

Kategorija:Geni na hromosomu 9 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika