Protein sa homeoboksom 1, znan i kao protein 1 sa homeoboksnim vezanjem telomere (HOT1), je protein koji je kod ljudi kodiran genom HMBOX1. HMBOX1 directly binds to the double-stranded repeat sequence of telomeres.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 420 aminokiselina, а molekulska težina 47.278 Da.
1020304050 MLSSFPVVLLETMSHYTDEPRFTIEQIDLLQRLRRTGMTKHEILHALETL DRLDQEHSDKFGRRSSYGGSSYGNSTNNVPASSSTATASTQTQHSGMSPS PSNSYDTSPQPCTTNQNGRENNERLSTSNGKMSPTRYHANSMGQRSYSFE ASEEDLDVDDKVEELMRRDSSVIKEEIKAFLANRRISQAVVAQVTGISQS RISHWLLQQGSDLSEQKKRAFYRWYQLEKTNPGATLSMRPAPIPIEDPEW RQTPPPVSATSGTFRLRRGSRFTWRKECLAVMESYFNENQYPDEAKREEI ANACNAVIQKPGKKLSDLERVTSLKVYNWFANRRKEIKRRANIEAAILES HGIDVQSPGGHSNSDDVDGNDYSEQDDSTSHSDHQDPISLAVEMAAVNHT ILALARQGANEIKTEALDDD
Funkcija HMBOX1 je prvobitno identificiran da se povezuje s telomernim hromatinom u ćelijama raka pozitivnim na telomerazu i ćelijama raka koje održavaju svoje telomere na osnovu alternativnog produženje telomera (ALT) pomoću obrnutog ChIP tehnika PICh (eng. skr. od proteomika izoliranih segmenata hromatina). Nakon toga je demonstrirano direktno vezivanje za telomernu DNK, preko kokristalnih struktura domen koji veže DNK HMBOX1 sa telomernom DNK. Eksperimenti s gubitkom i pojačanjem funkcije, klasificiraju HMBOX1 kao pozitivnog regulatora dužine telomera. HMBOX1 je prvobitno bio opisivan kao transkripcijski represor, na temelju testova reporteskih gena, ali pristupi cijelom genomu koji koriste RNK-seq i ChIP-seq ne vide takav učinak ili ga uopće nemaju, barem u nekoliko ćelijskih linija raka.
Reference
Kategorija:Telomeri Kategorija:Geni na hromosomu 8 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika